132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2209 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2209  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
393 aa  762    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0133966  normal  0.166807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2094  hypothetical protein  39.13 
 
 
348 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0787184  normal  0.014964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  35.14 
 
 
368 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3012  hypothetical protein  35.19 
 
 
387 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1587  protein of unknown function UPF0118  36.24 
 
 
363 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1131  permease  33.93 
 
 
431 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  24.86 
 
 
334 aa  89.7  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  25.07 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  25.3 
 
 
321 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  25.76 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  31.91 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  25.39 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  22.12 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  29.56 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  24.15 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.74 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  24.92 
 
 
336 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  27.8 
 
 
423 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  22.11 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  24.25 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.69 
 
 
347 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  23 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  24.49 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  27.48 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  24.38 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  24.2 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  29.68 
 
 
347 aa  53.9  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  26.51 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  31.09 
 
 
351 aa  53.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  37.04 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  24.86 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  32.63 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  25.68 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  32.5 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  25.59 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  27.21 
 
 
381 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  24.25 
 
 
361 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  30.27 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  30.09 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  25.88 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  22.82 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  27.21 
 
 
352 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  25.82 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.89 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  27.47 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  29.3 
 
 
392 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  22.64 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  24.16 
 
 
387 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  24 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  25.33 
 
 
372 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.01 
 
 
358 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  26.56 
 
 
363 aa  49.7  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  23.85 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  24.71 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  23.9 
 
 
353 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  27.89 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  28.65 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  27.66 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  30.54 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  23.69 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  23.95 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.74 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  27.21 
 
 
330 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.86 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  28.8 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  24.07 
 
 
361 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  25.15 
 
 
354 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 
344 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  24.84 
 
 
365 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  22.84 
 
 
362 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  28.26 
 
 
353 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0383  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 
353 aa  46.6  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.810793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  29.95 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.14 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  23.31 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  24.6 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  29.08 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  22.48 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.68 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  24.86 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  25.33 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  29.59 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  29.27 
 
 
504 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.48 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  22.49 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  24.27 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  28.89 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.75 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.75 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  32.5 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  25.15 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  24.66 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  27.5 
 
 
425 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  23.64 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  31.94 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>