More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0445 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  768    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  42 
 
 
336 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  39.77 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  40 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  38.86 
 
 
336 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  38 
 
 
334 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  37.07 
 
 
334 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  39.07 
 
 
334 aa  239  9e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  37.08 
 
 
321 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  28.65 
 
 
351 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  26.33 
 
 
368 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  22.13 
 
 
393 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  25.07 
 
 
354 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  22.65 
 
 
339 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  22.8 
 
 
360 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  23.4 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  23.65 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  22.99 
 
 
425 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  24.15 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  21.98 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  23.51 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  24.13 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  23.16 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  27.46 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  22.16 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  22.22 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  22.55 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  21.53 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  21.93 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  20.53 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.14 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  28.31 
 
 
345 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  24.24 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.21 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  20.87 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  21.59 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  22.49 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  22.69 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  24.64 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  24.13 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  22.84 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  27.78 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  29.17 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  23.62 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  20.29 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  23.53 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  22.66 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  22.11 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  23.26 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  23.26 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  28.49 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  23.16 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  23.29 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  26.32 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  27.57 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  23.48 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  21.45 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  26.49 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  20.22 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  21.04 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  24.37 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  22.16 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  23.03 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  22.48 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  21.19 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  24.04 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  23.72 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  21.19 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  21.85 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  23.39 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.72 
 
 
360 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  27.72 
 
 
355 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  27.72 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  22.75 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.9 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  24.62 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  25.28 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  23.39 
 
 
352 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  26.63 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  24.73 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  26.63 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  22.54 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  26.63 
 
 
353 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  24.73 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  24.73 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  24.73 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  24.73 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  24.73 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  27.01 
 
 
350 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  24.73 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 
349 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  20.62 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  24.73 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>