More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0383 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0383  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 353 aa  690    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.810793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  28.36 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  27.22 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  24.12 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  22.58 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  25.71 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.4 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  26.01 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  25.37 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  26.71 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  21.78 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  26.69 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  22.06 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  25.86 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  24.62 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  26.33 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  26.77 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  26.71 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  25.36 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  24.47 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  22.29 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  25.38 
 
 		 363 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  27.01 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  29.17 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  25.65 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  24.72 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  26.4 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  29.76 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  27.89 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  26.45 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  26.4 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  29.76 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  28.28 
 
 		 409 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  25.22 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  28.19 
 
 		 361 aa  95.9  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  24.56 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  23.33 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  22.9 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  25.37 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  29.49 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  24.64 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  23.4 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  24.64 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  23.78 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  20.86 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  26.42 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.35 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  20.86 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  23.48 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  26.98 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  26.98 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  25.28 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  26.84 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  23.71 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  25.67 
 
 		 387 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  25.47 
 
 		 373 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  23.84 
 
 		 355 aa  89.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  24.28 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  30.34 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  22.71 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  23.8 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  23.37 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  24.16 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  23.1 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  21.97 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  28.65 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  25.29 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  26.23 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  24.4 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  25.68 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  25.36 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  24.32 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  25.82 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  23.65 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  22.44 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  22.51 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  22.51 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  22.51 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  22.51 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  19.33 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  22.51 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  22.51 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  22.51 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  24.56 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  21.49 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  27.35 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  22.16 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  22.16 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  22.16 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  22.16 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  23.24 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  22.16 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>