71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2094 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2094  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  680    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0787184  normal  0.014964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1587  protein of unknown function UPF0118  40.72 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2209  protein of unknown function UPF0118  39.26 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0133966  normal  0.166807 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3012  hypothetical protein  32.39 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 		 368 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1131  permease  33.98 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  25.07 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  28.4 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  24.55 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  26.95 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  21.38 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  23.71 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  23.68 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  24.01 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  23.26 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  24.31 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  24.86 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  25.15 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  26.64 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  24.02 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  23.39 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  24.02 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  24.02 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  24.02 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  24.02 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  24.02 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  25.66 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  24.02 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  21.6 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  25.07 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  24.11 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  22.25 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  23.05 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  22.49 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  21.53 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  24.8 
 
 		 365 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  29.06 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  29.06 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  21.49 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  24.02 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  28.21 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  22.81 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  23.08 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  19.33 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  19.41 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  23.58 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  23.08 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  25.52 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  21.43 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  23.08 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  23.08 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  23.08 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  23.5 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  26.53 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  21.91 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.65 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  25.11 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  26.5 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  24.4 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  24.14 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  21.94 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  22.12 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  23.96 
 
 		 362 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  22.8 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  23.1 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  26.74 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  22.64 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  29.41 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  24.04 
 
 		 355 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  24.88 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>