19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3012 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3012  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  755    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2209  protein of unknown function UPF0118  35.19 
 
 
393 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0133966  normal  0.166807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2094  hypothetical protein  32.39 
 
 
348 aa  170  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0787184  normal  0.014964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1131  permease  32.43 
 
 
431 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 
368 aa  142  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1587  protein of unknown function UPF0118  31.99 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  30.12 
 
 
393 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  22.12 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  20.53 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  21.52 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  21.07 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  22.92 
 
 
360 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  26.7 
 
 
361 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  28.64 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  25 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  21.2 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 
416 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>