191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1259 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 345 aa  672    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  59.05 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  34.05 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  29.03 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1366  hypothetical protein  29.49 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  24.7 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  24.79 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  23.48 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.87 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  25.08 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.8 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  24.55 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  22.69 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  25.39 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  23.44 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  24 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  23.26 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  27.88 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  26.49 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  23.12 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  23.76 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  24.85 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  25.38 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  23.65 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  32.33 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3764  protein of unknown function UPF0118  22.33 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  24.29 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  23.38 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  23.26 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  22.99 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  21.43 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  22.13 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  23.22 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  23.9 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  22.77 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  22.29 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  22.22 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  22.15 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  25.45 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  24.3 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  24.02 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  22.29 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  22.51 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2097  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.987772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  24.18 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  25.57 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  31.37 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  23.24 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  24.02 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  24.02 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  27.82 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  23.65 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  25.91 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  22.77 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  22.88 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  22.36 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  23.27 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  23.29 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  29.24 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  22.77 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  22.99 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  23.1 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  22.47 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  26.77 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  26.4 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  25.07 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  21.22 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  22.82 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  20.78 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  31.78 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  22.79 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  23.58 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  25.29 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  22.98 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  27.13 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  22.98 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  23.19 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  26.99 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  23.19 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  23.19 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  22.07 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  22.5 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  20.48 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  24.23 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  23.94 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  32.67 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  38.3 
 
 		 425 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  21.19 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  21.12 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  23.15 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  24.62 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  24.1 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>