More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0798 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0798  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
380 aa  715    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0747  hypothetical protein  93.18 
 
 
381 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0794  protein of unknown function UPF0118  92.78 
 
 
364 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0479876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  61.76 
 
 
363 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  44.08 
 
 
419 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  33.33 
 
 
398 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  33.14 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  33.03 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  30.46 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.41 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  32.13 
 
 
354 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  30.72 
 
 
361 aa  112  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  32.13 
 
 
354 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  29.88 
 
 
344 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  34.42 
 
 
354 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  32.48 
 
 
348 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  28.99 
 
 
365 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  33.13 
 
 
350 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  34.66 
 
 
364 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  32.52 
 
 
350 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  32.83 
 
 
349 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  34.75 
 
 
354 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  30.51 
 
 
354 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  29.62 
 
 
379 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  26.65 
 
 
394 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  30.03 
 
 
361 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
378 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 
384 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  33.99 
 
 
355 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  28.86 
 
 
379 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  28.42 
 
 
387 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  28.81 
 
 
423 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  30.37 
 
 
354 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  29.81 
 
 
409 aa  99.4  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  35.68 
 
 
361 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  27.38 
 
 
347 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  28.32 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  26.69 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  30.62 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25.07 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  27.3 
 
 
352 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.53 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  29.07 
 
 
354 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  28.03 
 
 
352 aa  95.9  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  33.05 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  33.54 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  26.18 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  27.27 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  26.65 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  27.3 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  27.49 
 
 
365 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  25.61 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  28.53 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  30.69 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  31.1 
 
 
381 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  32.18 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  30.36 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  30.36 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  30.77 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  27.22 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.76 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  25.87 
 
 
352 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  27.22 
 
 
355 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  31.96 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  30.12 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  25.21 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  26.93 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  28.65 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  26.88 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  29.14 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  32.88 
 
 
351 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  31.67 
 
 
363 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  32.88 
 
 
351 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  26.93 
 
 
350 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  26.93 
 
 
353 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  25.72 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  27.06 
 
 
339 aa  86.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.47 
 
 
359 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 
346 aa  86.3  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  30.29 
 
 
358 aa  86.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  26.55 
 
 
406 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.61 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  25.93 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.02 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.7 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  26.3 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  26.3 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  26.3 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  26.3 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.17 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  26.3 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  26.5 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  26.3 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  32.31 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  27.7 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>