More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0116 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0116  diguanylate cyclase  100 
 
 		 382 aa  773    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  34.03 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1296  diguanylate cyclase  32.19 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2408  diguanylate cyclase  32.55 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1004  GGDEF domain-containing protein  31.4 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  31.12 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0946  GGDEF domain-containing protein  31.4 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  28.76 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3387  diguanylate cyclase  34.73 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  40.96 
 
 		 202 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  41.07 
 
 		 524 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  37.11 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1471  diguanylate cyclase  32.69 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0238873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1169  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.32 
 
 		 596 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  38.51 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2253  diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 545 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346813  normal  0.544502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4417  diguanylate cyclase  32.75 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2774  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 530 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3686  diguanylate cyclase  33.2 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2754  diguanylate cyclase  37.11 
 
 		 518 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  43.17 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  35.03 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0694  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 536 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1817  GGDEF family protein  35.47 
 
 		 512 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  37.37 
 
 		 532 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  41.21 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  38.22 
 
 		 603 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  42.31 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3309  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430472  hitchhiker  0.00145526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3762  diguanylate cyclase  39.87 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742847  normal  0.824996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2556  GGDEF domain-containing protein  37.97 
 
 		 518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  35.52 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3603  diguanylate cyclase  38.65 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.943579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1148  diguanylate cyclase  40.13 
 
 		 634 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0203006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3458  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 518 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000037754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  42.07 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  27.7 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0389  GGDEF family protein  37.99 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 513 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2974  diguanylate cyclase  37.34 
 
 		 518 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 432 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2009  diguanylate cyclase  38.38 
 
 		 482 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0406773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  32.16 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0891  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0443  GGDEF domain-containing protein  38.85 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0613635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  40.34 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4161  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 640 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  36.11 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1650  diguanylate cyclase  35.08 
 
 		 472 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2418  GGDEF domain-containing protein  36.08 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.659104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2124  diguanylate cyclase  32.73 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0045948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0716  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.41 
 
 		 801 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.317239  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2015  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 249 aa  106  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0005  diguanylate cyclase  35.93 
 
 		 520 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1821  diguanylate cyclase  38.65 
 
 		 298 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.017871  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 544 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4684  GGDEF domain-containing protein  34.86 
 
 		 266 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 304 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1722  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4493  diguanylate cyclase  37.25 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2043  GGDEF domain-containing protein  36.94 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1758  response regulatory protein (sensory transduction system)  35.9 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.110721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03006  hypothetical protein  35.47 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0645  diguanylate cyclase  31.21 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.588566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2240  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1551  GGDEF domain-containing protein  35.44 
 
 		 518 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1910  GGDEF family protein  26.99 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2153  membrane associated GGDEF protein  32.8 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 495 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2170  diguanylate cyclase  30.56 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2135  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  34.55 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.96 
 
 		 505 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  39.05 
 
 		 583 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  37.35 
 
 		 532 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2394  GGDEF domain-containing protein  29.63 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1398  diguanylate cyclase  36.08 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0531857  decreased coverage  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2091  diguanylate cyclase  33.16 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4234  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 539 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.256126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1359  diguanylate cyclase  36.08 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0508  GGDEF domain-containing protein  39.39 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 523 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0892  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.501117 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1551  GGDEF domain-containing protein  39.39 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  37.35 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1222  GGDEF domain-containing protein  39.39 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2481  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0645  GGDEF domain-containing protein  39.39 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>