More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1004 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1004  GGDEF domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  736    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0946  GGDEF domain-containing protein  99.73 
 
 		 369 aa  733    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1296  diguanylate cyclase  63.41 
 
 		 389 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  33.89 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0116  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 393 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  30.73 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  42.55 
 
 		 202 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2408  diguanylate cyclase  29.54 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1938  diguanylate cyclase  36.33 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1471  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0238873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  45 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  36.79 
 
 		 578 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4417  diguanylate cyclase  35.53 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  41.46 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  42.13 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  35.94 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  44.12 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  41.54 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3185  diguanylate cyclase  37.61 
 
 		 347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.0939676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1887  diguanylate cyclase  38.04 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  44.64 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  35.56 
 
 		 416 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  43.6 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0259  diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.77 
 
 		 780 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00370  hypothetical protein with C-terminal GGDEF motif  43.03 
 
 		 529 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  45.16 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  38.19 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1231  diguanylate cyclase  35.88 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  44.65 
 
 		 459 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 753 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  42.59 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  40.49 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.88 
 
 		 777 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  40.11 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  41.76 
 
 		 628 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 587 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.94 
 
 		 790 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5832  diguanylate cyclase  40.45 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2553  diguanylate cyclase  41.01 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.928097  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  35.78 
 
 		 768 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2835  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0674  diguanylate cyclase  40.78 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00151  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  37.42 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  41.76 
 
 		 527 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.72 
 
 		 772 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0952  GGDEF domain-containing protein  39.15 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7359  putative diguanylate cyclase  42.13 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  37.42 
 
 		 458 aa  105  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2887  GGDEF domain-containing protein  37.29 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1895  diguanylate cyclase  36.2 
 
 		 555 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 736 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  40 
 
 		 301 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  37.43 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  32.82 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 495 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0968  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3823  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 690 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 735 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0886  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0459194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1030  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.12052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1485  diguanylate cyclase  35.78 
 
 		 490 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  39.04 
 
 		 689 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.1 
 
 		 994 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 714 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  37.14 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2774  diguanylate cyclase  41.77 
 
 		 530 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.88 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5350  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0806  GGDEF family protein  41.4 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2668  diguanylate cyclase  39.78 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  33.49 
 
 		 712 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  38.62 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  40.62 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  34.18 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  33.83 
 
 		 471 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2364  diguanylate cyclase  41.46 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000850784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2151  hypothetical protein  39.87 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  39.51 
 
 		 580 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1783  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.24 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1036  diguanylate cyclase  40.61 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  35.5 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1769  diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 464 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.128605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2394  GGDEF domain-containing protein  36.65 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2253  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 545 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346813  normal  0.544502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1163  diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4666  diguanylate cyclase  33.5 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00608192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>