More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2009 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2135  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  69.11 
 
 		 472 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1722  diguanylate cyclase  69.33 
 
 		 472 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2009  diguanylate cyclase  100 
 
 		 482 aa  987    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0406773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1650  diguanylate cyclase  68.9 
 
 		 472 aa  661    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01479  predicted diguanylate cyclase  67.09 
 
 		 315 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2124  diguanylate cyclase  67.09 
 
 		 315 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0045948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2136  diguanylate cyclase  67.09 
 
 		 315 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01490  hypothetical protein  67.09 
 
 		 315 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1604  diguanylate cyclase  68.84 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.608459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1338  diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 469 aa  296  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0898942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2643  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1902  diguanylate cyclase  36.23 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3566  diguanylate cyclase  35.82 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000340192  normal  0.133927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3222  diguanylate cyclase  34.08 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0257406  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3932  GGDEF domain-containing protein  36.86 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0460046  normal  0.0449819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1181  diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 482 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2518  diguanylate cyclase  30.32 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.784165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0540  diguanylate cyclase  27.77 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0757  diguanylate cyclase  26.47 
 
 		 489 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.371772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3478  diguanylate cyclase  27.31 
 
 		 496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.289854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  39.56 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1012  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 295 aa  124  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1695  GGDEF family protein  40.94 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.037923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2154  GGDEF  34.53 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  40.66 
 
 		 525 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  33.58 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  36.92 
 
 		 493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  28.71 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1325  sensory box protein  36.87 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  34.21 
 
 		 395 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2173  diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1511  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4283  diguanylate cyclase  24.69 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  36.6 
 
 		 548 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 631 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  36.7 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1570  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  36.79 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3587  diguanylate cyclase  29.87 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.684884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  36.25 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  33.75 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  37.97 
 
 		 498 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  35.98 
 
 		 357 aa  113  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3693  response regulator receiver domain-containing protein  27.68 
 
 		 476 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.963643  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 493 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3392  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.38 
 
 		 406 aa  113  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  29.86 
 
 		 334 aa  113  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  34.88 
 
 		 578 aa  113  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  36.25 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  37.97 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  34.9 
 
 		 624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0886  diguanylate cyclase  37.87 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0459194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1030  diguanylate cyclase  37.87 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.12052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  37.97 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2754  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2636  diguanylate cyclase  33.9 
 
 		 220 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4599  diguanylate cyclase  37.76 
 
 		 231 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.711309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  37.8 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 		 309 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 307 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2466  diguanylate cyclase  33.53 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0503371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  37.21 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2668  diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1433  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.58748  normal  0.153521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  39.76 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  35.2 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  30.56 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  39.02 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  35.12 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1863  diguanylate cyclase  28.93 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.150647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2150  cellulose synthesis regulatory protein  39.78 
 
 		 570 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297138  normal  0.0131316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1132  cellulose synthesis regulatory protein  39.78 
 
 		 570 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1253  cellulose synthesis regulatory protein  39.78 
 
 		 570 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.839594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2146  cellulose synthesis regulatory protein  39.78 
 
 		 570 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.256949  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2204  cellulose synthesis regulatory protein  39.78 
 
 		 570 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315572  normal  0.912149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1721  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.176219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0797  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 408 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.95 
 
 		 730 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.98 
 
 		 306 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0754  diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  37.8 
 
 		 457 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.46 
 
 		 306 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0968  diguanylate cyclase  30.93 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.29 
 
 		 314 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0569  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  41.48 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  37.8 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  34.17 
 
 		 291 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0198  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 312 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1337  diguanylate cyclase  31.95 
 
 		 635 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.018023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1806  diguanylate cyclase  36.17 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.782438  hitchhiker  0.00449211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0443  GGDEF domain-containing protein  38.99 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0613635  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3387  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0116  diguanylate cyclase  38.38 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  37.36 
 
 		 308 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  33.67 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3762  diguanylate cyclase  28.52 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742847  normal  0.824996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 316 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>