More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4599 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4599  diguanylate cyclase  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.711309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3566  diguanylate cyclase  48.73 
 
 		 460 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000340192  normal  0.133927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3932  GGDEF domain-containing protein  47.72 
 
 		 402 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0460046  normal  0.0449819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1902  diguanylate cyclase  47.72 
 
 		 469 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3222  diguanylate cyclase  47.72 
 
 		 469 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0257406  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2518  diguanylate cyclase  43.72 
 
 		 500 aa  164  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.784165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1181  diguanylate cyclase  42.78 
 
 		 482 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3478  diguanylate cyclase  42.56 
 
 		 496 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.289854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  41.23 
 
 		 680 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1751  diguanylate cyclase  41.52 
 
 		 389 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  46.2 
 
 		 548 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0470  GGDEF  44.58 
 
 		 412 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1197  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.7 
 
 		 457 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  38.12 
 
 		 493 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  43.1 
 
 		 354 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  42.41 
 
 		 611 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2636  diguanylate cyclase  36.41 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 569 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3108  diguanylate cyclase  43.35 
 
 		 411 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26970  hypothetical protein  42.46 
 
 		 525 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2284  hypothetical protein  41.76 
 
 		 525 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0619167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2887  GGDEF domain-containing protein  42.26 
 
 		 424 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1368  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.58 
 
 		 818 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.567434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  37.62 
 
 		 493 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  36.42 
 
 		 364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 493 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4086  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.97 
 
 		 820 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0538  diguanylate cyclase  41.28 
 
 		 381 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  46.84 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  41.4 
 
 		 564 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  36.54 
 
 		 499 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1235  diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 577 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  42.08 
 
 		 492 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  40.84 
 
 		 411 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.61 
 
 		 769 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  41.4 
 
 		 563 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0187  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.87 
 
 		 469 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  40.11 
 
 		 462 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1821  diguanylate cyclase  40.34 
 
 		 298 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.017871  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5832  diguanylate cyclase  39.45 
 
 		 381 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361903 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1433  diguanylate cyclase  43.48 
 
 		 387 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.58748  normal  0.153521 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2036  diguanylate cyclase  39.35 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0190259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1304  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 581 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00414858  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1313  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 581 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.386041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  43.03 
 
 		 307 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  43.9 
 
 		 411 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  46.84 
 
 		 381 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1340  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 581 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3046  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 581 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.860652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2262  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 430 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2077  diguanylate cyclase  40.7 
 
 		 382 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.793636  normal  0.406002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3655  PAS:GGDEF  40.44 
 
 		 820 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.979803  normal  0.755172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2698  diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 410 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.110295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2364  diguanylate cyclase  37.66 
 
 		 351 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000850784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  40.84 
 
 		 396 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3910  diguanylate cyclase  38.22 
 
 		 537 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283041  normal  0.244259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  34.12 
 
 		 498 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3185  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.52 
 
 		 482 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2750  diguanylate cyclase  39.68 
 
 		 380 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0577  diguanylate cyclase  36.41 
 
 		 378 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.299123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1761  sensory box protein/GGDEF family protein  39.9 
 
 		 973 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4666  diguanylate cyclase  38.24 
 
 		 407 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00608192  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  37.95 
 
 		 458 aa  122  6e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.9 
 
 		 818 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260128  decreased coverage  0.0078854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1352  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.41 
 
 		 818 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 681 aa  121  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  44.71 
 
 		 409 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  41.71 
 
 		 495 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4901  hypothetical protein  42.01 
 
 		 375 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.87 
 
 		 301 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  41.14 
 
 		 296 aa  121  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 316 aa  121  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0504  GGDEF domain-containing protein  41.57 
 
 		 385 aa  121  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1480  GGDEF family protein  38.04 
 
 		 596 aa  121  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1272  diguanylate cyclase  42.44 
 
 		 632 aa  121  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0623275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  36.42 
 
 		 949 aa  121  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  39.39 
 
 		 565 aa  121  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  38.04 
 
 		 369 aa  121  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03704  GGDEF domain protein  38.74 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2946  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 575 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4172  GGDEF domain-containing protein  39.26 
 
 		 431 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0231  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.57 
 
 		 342 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  38.27 
 
 		 458 aa  121  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0886  diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 542 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1619  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.34 
 
 		 632 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.702165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4247  diguanylate cyclase  37.71 
 
 		 395 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  36.65 
 
 		 722 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1808  diguanylate cyclase  37.37 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1737  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  40.44 
 
 		 818 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2567  diguanylate cyclase  43.35 
 
 		 397 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3010  diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0798808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2623  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  39.18 
 
 		 626 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.616722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2747  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0538  diguanylate cyclase  39.44 
 
 		 585 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56280  hypothetical protein  41.07 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4658  hypothetical protein  40.62 
 
 		 818 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142401  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  40.38 
 
 		 564 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2593  diguanylate cyclase  40.25 
 
 		 569 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2332  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.53 
 
 		 324 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.532356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>