More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3603 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3603  diguanylate cyclase  100 
 
 		 381 aa  772    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.943579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0131  diguanylate cyclase  39.2 
 
 		 392 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0130  diguanylate cyclase  38.03 
 
 		 392 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0525  GGDEF family protein  35.28 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4164  diguanylate cyclase  29.1 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  39.43 
 
 		 493 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3686  diguanylate cyclase  28.23 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  30.79 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  39.43 
 
 		 493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 512 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  38.27 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3387  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0489  diguanylate cyclase  38.86 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  38.86 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3752  diguanylate cyclase  32.54 
 
 		 436 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  35.58 
 
 		 578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  31.14 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2441  diguanylate cyclase  27.44 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  38.33 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2736  diguanylate cyclase  28.23 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02934  hypothetical protein  36.16 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4428  diguanylate cyclase  29.59 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  38.64 
 
 		 738 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  37.29 
 
 		 513 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1910  GGDEF family protein  27.22 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  39.55 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0116  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  39.75 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22780  GGDEF protein  39.2 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0043996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1742  diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0534167  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.13 
 
 		 901 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 715 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0094  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.08 
 
 		 602 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  39.05 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1998  diguanylate cyclase  30.68 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0959773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 642 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01318  predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein  39.41 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.536328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2303  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.41 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.71 
 
 		 730 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2513  diguanylate cyclase  28.23 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1555  sensory box-containing diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0698  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814063  hitchhiker  0.00133482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1989  sensory box-containing diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4429  diguanylate cyclase  29.13 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1781  sensory box-containing diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 532 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01328  hypothetical protein  39.41 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.465042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1458  sensory box-containing diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  39.51 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 732 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  40 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  39.08 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5099  diguanylate cyclase  38.3 
 
 		 653 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.873917  normal  0.160564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  39.16 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1357  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 508 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 564 aa  109  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2284  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.82 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4604  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0265  diguanylate cyclase  27.99 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  39.49 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.37 
 
 		 632 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 696 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 1037 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1356  diguanylate cyclase  39.74 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001391  GGDEF domain protein  36.97 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00410317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 432 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  37.14 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1938  diguanylate cyclase  39.63 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  40.8 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  39.08 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2212  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.69 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4283  diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0676  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  40.83 
 
 		 645 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  42.14 
 
 		 202 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  28.96 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2147  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.59 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0636  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 559 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  40.49 
 
 		 591 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1809  diguanylate cyclase  28.75 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271583  hitchhiker  0.00508351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2104  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 546 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0835719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3603  GGDEF domain-containing protein  40.1 
 
 		 641 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2855  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220747  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  38.73 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  39.64 
 
 		 645 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1783  diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 253 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203678  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  31.22 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1311  hypothetical protein  38.82 
 
 		 792 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>