More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1296 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1296  diguanylate cyclase  100 
 
 		 389 aa  781    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1004  GGDEF domain-containing protein  63.41 
 
 		 369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0946  GGDEF domain-containing protein  63.14 
 
 		 369 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0116  diguanylate cyclase  32.19 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  31.79 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  30.67 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2408  diguanylate cyclase  29.04 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  29.32 
 
 		 392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1938  diguanylate cyclase  43.09 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  44.86 
 
 		 202 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  26.82 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1471  diguanylate cyclase  33.9 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0238873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4417  diguanylate cyclase  34.06 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  42.26 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.25 
 
 		 780 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1063  GGDEF family protein  39.77 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  42.77 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4164  diguanylate cyclase  32.64 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4720  diguanylate cyclase  37.44 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  38.01 
 
 		 578 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2668  diguanylate cyclase  40.1 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 482 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0886  diguanylate cyclase  38.99 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0459194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1030  diguanylate cyclase  38.99 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.12052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  39.63 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.68 
 
 		 790 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  39.87 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3428  diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  34.63 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1902  diguanylate cyclase  40.21 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  31.7 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  34.63 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2754  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1510  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  40.59 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.865852  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  34.63 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.76 
 
 		 777 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.12 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2364  diguanylate cyclase  44.1 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000850784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 611 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  43.87 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1624  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.85 
 
 		 673 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  43.35 
 
 		 628 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 483 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0674  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  36.78 
 
 		 227 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  37.97 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7359  putative diguanylate cyclase  40.22 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3823  diguanylate cyclase  40.23 
 
 		 690 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.24 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4255  GGDEF  32.9 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1119  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0452  putative GGDEF protein  36.26 
 
 		 528 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3932  GGDEF domain-containing protein  40.21 
 
 		 402 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0460046  normal  0.0449819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 459 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2418  GGDEF domain-containing protein  40.51 
 
 		 518 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.659104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  34.08 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 420 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1895  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 555 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4901  hypothetical protein  39.64 
 
 		 375 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0544  diguanylate cyclase  42.51 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4161  diguanylate cyclase  30.85 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  38.27 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  38.22 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3309  diguanylate cyclase  40 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430472  hitchhiker  0.00145526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.82 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0138  diguanylate cyclase  39.16 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  31.15 
 
 		 738 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  36.75 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  33.68 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1301  diguanylate cyclase  39.53 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  37.43 
 
 		 735 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3603  diguanylate cyclase  38.86 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.943579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2986  diguanylate cyclase  39.87 
 
 		 518 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000165218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  35.12 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1887  diguanylate cyclase  34.36 
 
 		 517 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3458  diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000037754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  36.82 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1036  diguanylate cyclase  30.67 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  39 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0694  diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  37.97 
 
 		 493 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1359  diguanylate cyclase  39.87 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4428  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.67 
 
 		 772 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1373  diguanylate cyclase  39.87 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1291  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 518 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  36.88 
 
 		 488 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1398  diguanylate cyclase  39.87 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0531857  decreased coverage  0.00306238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.3 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4379  diguanylate cyclase  38.38 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00370  hypothetical protein with C-terminal GGDEF motif  40.61 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 612 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1226  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.71 
 
 		 807 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2884  diguanylate cyclase  39.24 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000014858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>