More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2385 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  100 
 
 		 362 aa  726    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  59.66 
 
 		 369 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  44.57 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  44.69 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  44.69 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  40.11 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  40.11 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  40.11 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  38.48 
 
 		 388 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  38.68 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  39.72 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  39.72 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  40.52 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  39.09 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  38.44 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  38.44 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  38.44 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  38 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  43.77 
 
 		 286 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  33.8 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  33.81 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 370 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  31.68 
 
 		 361 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  30.34 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  30.49 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  42.33 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1847  diguanylate cyclase  34.65 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1194  diguanylate cyclase  43.56 
 
 		 471 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361877  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2619  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2431  diguanylate cyclase  40.7 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.966679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2222  diguanylate cyclase  39.76 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0027044  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2298  diguanylate cyclase  39.76 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.44184  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1814  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000814  hypothetical protein  30.52 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.67 
 
 		 572 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 570 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.6 
 
 		 772 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  42.13 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.61 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3932  GGDEF domain-containing protein  41.57 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0460046  normal  0.0449819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1893  hypothetical protein  40.99 
 
 		 533 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0317418  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  37.35 
 
 		 611 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  41.72 
 
 		 680 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  39.76 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3566  diguanylate cyclase  40.35 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000340192  normal  0.133927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  41.88 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  36.06 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  37.21 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  39.16 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  37.61 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22780  GGDEF protein  40 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0043996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1902  diguanylate cyclase  40.96 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1891  diguanylate cyclase  39.39 
 
 		 466 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.311116  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.73 
 
 		 610 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4161  diguanylate cyclase  35.76 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 753 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3603  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.943579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1821  diguanylate cyclase  39.39 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1920  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  38.65 
 
 		 569 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3087  diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0674  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0131  diguanylate cyclase  38.75 
 
 		 392 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.95 
 
 		 901 aa  102  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 492 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2365  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 467 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108211  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  35.18 
 
 		 491 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.59 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  37.72 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4730  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 572 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  35.64 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  36.99 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.49 
 
 		 730 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 681 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1528  diguanylate cyclase  36.02 
 
 		 1339 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.646539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  40.83 
 
 		 493 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1174  GGDEF domain-containing protein  35.44 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.18 
 
 		 1125 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.79 
 
 		 505 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1903  diguanylate cyclase  38.18 
 
 		 466 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>