More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5270 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  99.72 
 
 		 360 aa  711    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  100 
 
 		 360 aa  715    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  100 
 
 		 360 aa  715    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  50.96 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  49.3 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  49.3 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  49.02 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  44.1 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  45.09 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 373 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 373 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 373 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  42.49 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  41.69 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  41.69 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 388 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  40.11 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  40.5 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  41.08 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  44.17 
 
 		 286 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  34.93 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  32.67 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  32.67 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  32.67 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  32.58 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  32.78 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  30.79 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  33.69 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  40 
 
 		 574 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  40 
 
 		 574 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  39.64 
 
 		 611 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.85 
 
 		 1072 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1395  diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.52 
 
 		 568 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  41.21 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2057  diguanylate cyclase  30.57 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0373556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  31.59 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  34.29 
 
 		 578 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0283  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714605  normal  0.0176427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  41.28 
 
 		 385 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  39.39 
 
 		 580 aa  99.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4161  diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0245  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  38.89 
 
 		 1076 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.57 
 
 		 675 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 524 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 548 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  36.2 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1485  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 490 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  35.35 
 
 		 488 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  35.58 
 
 		 493 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32350  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  43.71 
 
 		 628 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 540 aa  96.7  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3406  diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0807  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.67 
 
 		 803 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  35.08 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 477 aa  96.3  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  36.45 
 
 		 753 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0422  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1923  diguanylate cyclase  43.12 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0213654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3380  GGDEF domain-containing protein  35.43 
 
 		 1479 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 608 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3605  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.41 
 
 		 647 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4417  diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.14 
 
 		 743 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  33.54 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4730  diguanylate cyclase  41.04 
 
 		 572 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.46 
 
 		 668 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.04 
 
 		 891 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.91 
 
 		 668 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1592  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.58 
 
 		 823 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  34.48 
 
 		 583 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.88 
 
 		 578 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  32.17 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 493 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  35.15 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  35.15 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.98 
 
 		 783 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2597  GGDEF  34.8 
 
 		 534 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 570 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2393  signal transduction protein  35.56 
 
 		 817 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.512634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1301  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  32.49 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6542  diguanylate cyclase  39.43 
 
 		 438 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2431  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.966679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  29.49 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 623 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  35.5 
 
 		 609 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  30.17 
 
 		 510 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0031  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 501 aa  93.6  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0530472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  37.87 
 
 		 735 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3774  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36 
 
 		 1487 aa  93.6  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293426  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  35.5 
 
 		 709 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2766  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.98 
 
 		 782 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>