More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0112 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  100 
 
 		 361 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  77.09 
 
 		 361 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  32.87 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  32.04 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  34.27 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  35.15 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 361 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 361 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  32.04 
 
 		 370 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  32.3 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  32.3 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 373 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 373 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 373 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  32.97 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  27.45 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  27.45 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  27.45 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  34.28 
 
 		 286 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000814  hypothetical protein  31.72 
 
 		 402 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  41.82 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0581  response regulator  39.13 
 
 		 417 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000040809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  41.88 
 
 		 566 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1357  diguanylate cyclase  40.88 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  40.96 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  30.47 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  37.07 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 342 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2680  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  40.57 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  32.58 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  42.08 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  35.78 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  40 
 
 		 532 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  43.1 
 
 		 457 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  44.65 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  32.16 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  41.9 
 
 		 523 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  43.03 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.49 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  40.7 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 495 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  40.59 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  42.05 
 
 		 457 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  33.15 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  46.15 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3349  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.51 
 
 		 656 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  30.06 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  36.48 
 
 		 578 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  42.41 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2332  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.3 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.532356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  41.77 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2989  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 577 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1737  diguanylate cyclase  35.38 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0222793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1695  GGDEF family protein  37.7 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.037923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  41.95 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  40.22 
 
 		 532 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0426  putative GGDEF protein  32.99 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  37.65 
 
 		 458 aa  106  6e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 681 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  38.92 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 632 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2157  diguanylate cyclase  35.53 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  37.87 
 
 		 458 aa  105  8e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  40.8 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  43.67 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  33.05 
 
 		 370 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  43.67 
 
 		 417 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  37.57 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1395  diguanylate cyclase  36.96 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2147  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.57 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  37.56 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  38.42 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0694  diguanylate cyclase  35.76 
 
 		 536 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4245  GGDEF domain-containing protein  40.37 
 
 		 477 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3762  diguanylate cyclase  31.84 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742847  normal  0.824996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  41.86 
 
 		 457 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4429  diguanylate cyclase  44.31 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0569  diguanylate cyclase  39.77 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 554 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3486  diguanylate cyclase  45 
 
 		 449 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0757  diguanylate cyclase  30.55 
 
 		 489 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.371772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  40.51 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>