More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5210 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  100 
 
 		 373 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  100 
 
 		 373 aa  744    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  100 
 
 		 373 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  46.07 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  46.31 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  46.07 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  44.23 
 
 		 360 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  41.97 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  41.97 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  40.56 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  41.37 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  39.65 
 
 		 360 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  39.56 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  44.56 
 
 		 286 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  38.44 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  34.82 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  34.82 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  35.11 
 
 		 371 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  33.15 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  30.81 
 
 		 371 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  29.67 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  32.49 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  27.96 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 611 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4161  diguanylate cyclase  34.52 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.78 
 
 		 836 aa  96.7  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  36.63 
 
 		 719 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2195  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 496 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.741232  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56280  hypothetical protein  41.51 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 540 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2588  response regulator receiver protein  39.75 
 
 		 568 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  29.86 
 
 		 532 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 392 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5014  response regulator/sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  36.05 
 
 		 719 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  33.48 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1138  diguanylate cyclase  36.69 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0884  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.576242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  29.65 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0983  GGDEF family protein  34.94 
 
 		 443 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  31.55 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  27.17 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2518  diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 500 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.784165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3516  diguanylate cyclase  42.14 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4417  diguanylate cyclase  40 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3264  diguanylate cyclase  40.25 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  34.57 
 
 		 458 aa  90.1  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3387  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 442 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2249  response regulator/GGDEF domain-containing protein  36.59 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  40.72 
 
 		 470 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4901  hypothetical protein  40.25 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 557 aa  89.7  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  31.98 
 
 		 532 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1539  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.64 
 
 		 681 aa  89.7  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0594257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 517 aa  89.7  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.61 
 
 		 367 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 718 aa  89.4  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1665  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 530 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3028  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  31.36 
 
 		 694 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.16 
 
 		 1466 aa  88.6  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4330  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.97 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 587 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0697  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.184616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0440  hypothetical protein  25.79 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1659  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.52 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  33.18 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 473 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 420 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.32 
 
 		 550 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1641  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.68 
 
 		 755 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.130236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4283  diguanylate cyclase  24.64 
 
 		 480 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0416  hypothetical protein  30.47 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  35.06 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  32.1 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2600  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.93 
 
 		 978 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.861539  normal  0.836089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.29 
 
 		 563 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  34.5 
 
 		 820 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0542  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 285 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4959  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.97 
 
 		 708 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  37.27 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.49 
 
 		 632 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1835  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.74 
 
 		 654 aa  86.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0773497  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 564 aa  87  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1657  diguanylate cyclase  41.4 
 
 		 530 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1017  GGDEF family protein  36.77 
 
 		 1051 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  35.71 
 
 		 799 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0333  GGDEF domain-containing protein  31.03 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  33.95 
 
 		 458 aa  86.7  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.97 
 
 		 708 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>