More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3822 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  100 
 
 		 358 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  41.16 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  41.16 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  41.23 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  39.19 
 
 		 361 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  39.19 
 
 		 361 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  39.83 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  40 
 
 		 360 aa  222  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  39.09 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 364 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  39.56 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  39.56 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  39.56 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  38.2 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  42.18 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  38.37 
 
 		 371 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 371 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  38.48 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  33.43 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  33.43 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  33.43 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  35.38 
 
 		 370 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  33.05 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  31.3 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  30.92 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  42.61 
 
 		 680 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  32.23 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  30.8 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.07 
 
 		 1125 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  36.73 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 557 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  35.74 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  43.83 
 
 		 381 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  40.24 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.21 
 
 		 707 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.864356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  36.21 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2404  diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227226  normal  0.966476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.12 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  34.87 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.22 
 
 		 1072 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.27 
 
 		 772 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1762  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.45 
 
 		 1032 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1205  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.12 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.74 
 
 		 531 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  35.59 
 
 		 532 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  38.04 
 
 		 1826 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5011  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  40 
 
 		 681 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  43.56 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 570 aa  99.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1821  diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 298 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.017871  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0245  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  37.22 
 
 		 1076 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3516  diguanylate cyclase  42.17 
 
 		 370 aa  99.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  40.72 
 
 		 637 aa  99.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  30.98 
 
 		 304 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  40.99 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.51 
 
 		 610 aa  99.4  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2057  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0373556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  40.24 
 
 		 1093 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 564 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  36.2 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0265  diguanylate cyclase  38.15 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3406  diguanylate cyclase  37.89 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0196  diguanylate cyclase  35.93 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0542  diguanylate cyclase  34.54 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3010  diguanylate cyclase  34.23 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0798808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  36.65 
 
 		 477 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2239  diguanylate cyclase  42.17 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0221  GGDEF domain-containing protein  35.87 
 
 		 710 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2293  diguanylate cyclase  32.79 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000112238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  36.11 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  40.24 
 
 		 719 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3547  diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 314 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 611 aa  97.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6003  diguanylate cyclase  41.46 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  0.321238 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.94 
 
 		 632 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1174  GGDEF domain-containing protein  36.2 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1769  diguanylate cyclase  33.66 
 
 		 464 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.128605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.31 
 
 		 715 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  37.33 
 
 		 587 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3648  formamidopyrimidine-DNA glycolase  38.1 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  40 
 
 		 623 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3851  diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>