More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2463 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  100 
 
 
637 aa  1303    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.05 
 
 
646 aa  265  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.86 
 
 
505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  36.74 
 
 
659 aa  160  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.99 
 
 
424 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  46.19 
 
 
1000 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0164  diguanylate cyclase  44.29 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.890841  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  42.11 
 
 
420 aa  153  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1560  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
569 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  47.43 
 
 
378 aa  152  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.33 
 
 
686 aa  151  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3642  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.08 
 
 
796 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127426  normal  0.751556 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.69 
 
 
827 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.68 
 
 
419 aa  150  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  47.27 
 
 
227 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  44.44 
 
 
307 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.29 
 
 
302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2097  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.98 
 
 
800 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.82 
 
 
564 aa  148  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  48.62 
 
 
686 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1789  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.57 
 
 
794 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.993763  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1119  diguanylate cyclase  45.56 
 
 
325 aa  147  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2044  sensory box/GGDEF family protein  34.42 
 
 
762 aa  146  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  29.33 
 
 
532 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  45.88 
 
 
432 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.63 
 
 
301 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  38.33 
 
 
548 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.62 
 
 
791 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1609  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.98 
 
 
796 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.248445 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.11 
 
 
772 aa  144  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  37.81 
 
 
611 aa  144  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  50 
 
 
336 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2629  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.65 
 
 
821 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000585262  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.27 
 
 
769 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.65 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  46.67 
 
 
373 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3045  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.87 
 
 
878 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  48.78 
 
 
736 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.2 
 
 
698 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1616  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.18 
 
 
796 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1908  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.98 
 
 
519 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  40 
 
 
418 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1272  diguanylate cyclase  45.21 
 
 
632 aa  140  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0623275  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  41.09 
 
 
492 aa  140  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.75 
 
 
1078 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  37.02 
 
 
634 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1583  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.35 
 
 
444 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185074  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0119  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.58 
 
 
324 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969085  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.24 
 
 
642 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.46 
 
 
578 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1521  diguanylate cyclase  46.24 
 
 
237 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281404  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.36 
 
 
730 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4245  GGDEF domain-containing protein  40.56 
 
 
477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  45.4 
 
 
689 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  44.85 
 
 
354 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1197  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.46 
 
 
457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  44.38 
 
 
432 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  39.47 
 
 
425 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  36.65 
 
 
321 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.15 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.2 
 
 
572 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.11 
 
 
610 aa  136  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  38.68 
 
 
1055 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0488  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.31 
 
 
685 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.51 
 
 
1238 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0661  signal transduction protein  38.54 
 
 
1006 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  42.01 
 
 
738 aa  135  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1579  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.63 
 
 
324 aa  135  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.67 
 
 
314 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  47.34 
 
 
464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  43.53 
 
 
474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.2 
 
 
531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0748  diguanylate cyclase  42.78 
 
 
375 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3048  diguanylate cyclase  41.58 
 
 
398 aa  134  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  40.56 
 
 
413 aa  134  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  37.84 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.36 
 
 
890 aa  133  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2110  PAS:GGDEF  40 
 
 
796 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172113  normal  0.0218284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.59 
 
 
438 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0371  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.36 
 
 
890 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.58 
 
 
800 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.41 
 
 
901 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  35.58 
 
 
620 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.96 
 
 
709 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2313  sensory box/GGDEF domain protein  40.22 
 
 
323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447231  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.78 
 
 
1248 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1679  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.01 
 
 
1050 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  37.98 
 
 
611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  34.8 
 
 
988 aa  132  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  38.14 
 
 
467 aa  132  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0458  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.55 
 
 
1037 aa  132  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2969  sensory box/GGDEF family protein  32.44 
 
 
315 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0301  diguanylate cyclase  44.58 
 
 
389 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1297  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  41.9 
 
 
926 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.89 
 
 
353 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0296  diguanylate cyclase  44.58 
 
 
389 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0897488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  37.36 
 
 
487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1014  diguanylate cyclase  49.1 
 
 
552 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.737518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0297  diguanylate cyclase  44.58 
 
 
389 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3427  putative diguanylate cyclase (GGDEF)  42.86 
 
 
368 aa  131  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>