More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4318 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  100 
 
 		 372 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  100 
 
 		 372 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  100 
 
 		 372 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  49.73 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  49.73 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  49.73 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  35.88 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  35.83 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  33.43 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  33.89 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  33.89 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  32.95 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  32.95 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  32.67 
 
 		 360 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 362 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  35.77 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  35.11 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  33.24 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  32.87 
 
 		 371 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  29.53 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  28.01 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  27.86 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  26.48 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  26.54 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  31.41 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  32.08 
 
 		 623 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  31.87 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0413  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0267  diguanylate cyclase  29.27 
 
 		 1320 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  35.15 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0689  putative diguanylate cyclase  30.19 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0245  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  32.74 
 
 		 1076 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  27.71 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.91 
 
 		 1072 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  25.62 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  27.54 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  31.37 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0265  diguanylate cyclase  24.89 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  24.12 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2680  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.73 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  28.96 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2057  diguanylate cyclase  25.56 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0373556  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  29.65 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3349  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.04 
 
 		 656 aa  63.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2747  diguanylate cyclase  31.95 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06699  hypothetical protein  26.92 
 
 		 452 aa  62.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2698  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.110295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4239  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.95 
 
 		 695 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4349  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.95 
 
 		 695 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.967572  normal  0.71364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  29.24 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  30.25 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  28.14 
 
 		 775 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.21 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  31.52 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1290  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3720  diguanylate cyclase  32.7 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2195  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.741232  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  33.13 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1665  diguanylate cyclase  32.07 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  28.03 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4490  diguanylate cyclase  28.33 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3115  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.972183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3330  diguanylate cyclase  26.52 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  26.99 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5014  response regulator/sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  30.67 
 
 		 719 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2165  diguanylate cyclase  26.29 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000162389  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.85 
 
 		 689 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  29.94 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1742  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0534167  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1657  diguanylate cyclase  31.52 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.31 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0397  diguanylate cyclase  27.33 
 
 		 555 aa  59.7  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.63 
 
 		 557 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  30.57 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3776  hypothetical protein  37.4 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  30.06 
 
 		 719 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0797  diguanylate cyclase  28.92 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2157  diguanylate cyclase  30.11 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1716  diguanylate cyclase  25.9 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  27.62 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1306  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.76 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00348549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>