More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0679 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  100 
 
 		 367 aa  720    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  35.15 
 
 		 361 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  35.65 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  32.42 
 
 		 371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  32.31 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  32.31 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  34.08 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  32.68 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  32.05 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  30.92 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  33.6 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  33.97 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  33.97 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  33.69 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  33.69 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  35.11 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  30.9 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 362 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  29.44 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  30.22 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  28.37 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  30.7 
 
 		 373 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  30.7 
 
 		 373 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  30.7 
 
 		 373 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  42.94 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  42.94 
 
 		 308 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  42.94 
 
 		 308 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  42.94 
 
 		 308 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  42.94 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2239  diguanylate cyclase  39.53 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.942581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  28.76 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3663  GGDEF domain-containing protein  41.98 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2066  diguanylate cyclase  41.98 
 
 		 419 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.484782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  39.04 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  26.85 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0283  diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 544 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 523 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1867  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.64 
 
 		 710 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.559225  normal  0.957058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3387  diguanylate cyclase  31.33 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3686  diguanylate cyclase  38.99 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  43.18 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3816  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 526 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  37.79 
 
 		 488 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 523 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  32.46 
 
 		 458 aa  93.6  5e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 443 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0211  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.59 
 
 		 638 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  36.63 
 
 		 448 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1484  diguanylate cyclase  33.5 
 
 		 615 aa  92.8  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 1099 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  43.04 
 
 		 738 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  37.85 
 
 		 532 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  38.99 
 
 		 524 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  37.65 
 
 		 565 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  36 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  36 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2240  diguanylate cyclase  35.5 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37690  putative sensory box protein  41.88 
 
 		 864 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0535605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  36 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1887  diguanylate cyclase  31.87 
 
 		 517 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  40.36 
 
 		 563 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  31.19 
 
 		 640 aa  90.5  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  38.69 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.53 
 
 		 892 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1649  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 453 aa  90.1  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.103879  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  39.08 
 
 		 527 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2057  diguanylate cyclase  30.75 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0373556  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  37.65 
 
 		 273 aa  89.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  34.64 
 
 		 641 aa  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3627  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 526 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4106  GGDEF domain/EAL domain protein  37.42 
 
 		 756 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2597  GGDEF  40.25 
 
 		 534 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3868  diguanylate cyclase  35.08 
 
 		 517 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1231  diguanylate cyclase  32.73 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4164  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562104  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  40.57 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2546  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 564 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0032266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2969  sensory box/GGDEF family protein  38.65 
 
 		 315 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5479  sensory box/GGDEF family protein  33.53 
 
 		 892 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3412  diguanylate cyclase  33.91 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3843  GGDEF  37.04 
 
 		 763 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3702  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.21 
 
 		 692 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561666  normal  0.977889 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  30.53 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2989  diguanylate cyclase  24.91 
 
 		 628 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542118  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  38.1 
 
 		 457 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 457 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.05 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  35.83 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1893  hypothetical protein  40.24 
 
 		 533 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0317418  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5469  GGDEF  40.36 
 
 		 419 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05399  hypothetical protein  37.2 
 
 		 480 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3678  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.91 
 
 		 418 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 608 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.73 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3676  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000048428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>