More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4002 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  100 
 
 		 369 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  59.66 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  40.23 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  40.23 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  37.96 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  38.2 
 
 		 358 aa  222  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  40.66 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  39.3 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  39.3 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  40 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  43.75 
 
 		 286 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  36.87 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  34.23 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  34.23 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  34.23 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  33.24 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  33.24 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  33.24 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  33.8 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  31.77 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  31.96 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  29.78 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  28.85 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  28.65 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  30.12 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2293  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000112238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2365  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108211  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  40.43 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  31.04 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4161  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.59 
 
 		 708 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  34.87 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4959  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.59 
 
 		 708 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0587  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.52 
 
 		 1062 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.13 
 
 		 675 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3406  diguanylate cyclase  36.73 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2483  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 467 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 611 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0023  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 584 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0108472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3016  GGDEF domain-containing protein  36.47 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0864603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2009  diguanylate cyclase  34.42 
 
 		 482 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0406773 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  34.04 
 
 		 477 aa  93.2  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 471 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1017  GGDEF family protein  32.46 
 
 		 1051 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1650  sensory box protein  37.2 
 
 		 819 aa  92.8  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00487383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3108  diguanylate cyclase  35.18 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.25 
 
 		 836 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.07 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2337  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.16 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3823  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 690 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4392  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.361325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0556  diguanylate cyclase  33.99 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 459 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  35.08 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  33.17 
 
 		 524 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.69 
 
 		 1059 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.730556  normal  0.0496906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  35.87 
 
 		 719 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.91 
 
 		 461 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0413  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.91 
 
 		 461 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  37.5 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3919  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.556135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4417  diguanylate cyclase  36.32 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  30.94 
 
 		 574 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.52 
 
 		 707 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.864356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  32.76 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3492  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 474 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 587 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.53 
 
 		 994 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0131  diguanylate cyclase  37.89 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1510  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  36.7 
 
 		 581 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.865852  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.94 
 
 		 769 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  33.17 
 
 		 411 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  35.58 
 
 		 513 aa  89.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1474  diguanylate cyclase  36.99 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3143  diguanylate cyclase  31.56 
 
 		 614 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  31.88 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2588  response regulator receiver protein  40.25 
 
 		 568 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2593  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 569 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0536  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 604 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000248515  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  29.8 
 
 		 422 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0664  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.46 
 
 		 307 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1181  diguanylate cyclase  34.66 
 
 		 482 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1814  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 267 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2458  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038225 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  36.31 
 
 		 609 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>