More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2458 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2458  diguanylate cyclase  100 
 
 
351 aa  676    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2096  diguanylate cyclase  52.87 
 
 
584 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  50.62 
 
 
491 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0247  diguanylate cyclase  54.22 
 
 
513 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0161345  hitchhiker  0.00488955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2455  diguanylate cyclase  48.12 
 
 
699 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0350  diguanylate cyclase  51.92 
 
 
776 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3507  diguanylate cyclase  45.55 
 
 
487 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  44.51 
 
 
425 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  38.26 
 
 
372 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  38.19 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  42.79 
 
 
753 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  45.36 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  42.63 
 
 
418 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  46.15 
 
 
523 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  42.01 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  43.75 
 
 
736 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  45.56 
 
 
474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3862  diguanylate cyclase  51.33 
 
 
318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3413  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.74 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  44.94 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  45.54 
 
 
583 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1745  diguanylate cyclase  40.72 
 
 
401 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.597218  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  39.9 
 
 
227 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  39.69 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  45.13 
 
 
522 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  39.9 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  36.9 
 
 
738 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  47.44 
 
 
555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  40.89 
 
 
510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2950  diguanylate cyclase  45.11 
 
 
485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805106  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.88 
 
 
675 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3903  diguanylate cyclase  46.52 
 
 
370 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0522591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  41.27 
 
 
671 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1357  diguanylate cyclase  44.72 
 
 
508 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  41.88 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  36.88 
 
 
381 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0567  diguanylate cyclase  45.09 
 
 
377 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4124  diguanylate cyclase  39.16 
 
 
485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  41.8 
 
 
668 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  44.9 
 
 
498 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0034  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.91 
 
 
728 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  36.6 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4776  diguanylate cyclase  43.96 
 
 
403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  40.8 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  44.26 
 
 
510 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  39.66 
 
 
510 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1211  diguanylate cyclase  41.04 
 
 
578 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.03 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  31.98 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  39.66 
 
 
510 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  44.04 
 
 
642 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.82 
 
 
301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  45.71 
 
 
507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  43.6 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1282  diguanylate cyclase  40.46 
 
 
578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3624  diguanylate cyclase  34.08 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.112804  normal  0.505096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  41.74 
 
 
474 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.68 
 
 
917 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.08 
 
 
941 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4161  diguanylate cyclase  43.3 
 
 
490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704055  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  47.02 
 
 
569 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  41.67 
 
 
492 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  45.35 
 
 
385 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.31 
 
 
302 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2077  diguanylate cyclase  44.38 
 
 
382 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.793636  normal  0.406002 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  40.86 
 
 
565 aa  126  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4084  diguanylate cyclase  45.91 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2157  diguanylate cyclase  40 
 
 
372 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.63 
 
 
603 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4379  diguanylate cyclase  45.93 
 
 
419 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2750  diguanylate cyclase  33.97 
 
 
380 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1418  diguanylate cyclase  39.89 
 
 
466 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  44 
 
 
487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3066  GGDEF domain-containing protein  39.89 
 
 
466 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  44 
 
 
487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1212  diguanylate cyclase  39.18 
 
 
578 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  44 
 
 
487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1551  GGDEF domain-containing protein  39.89 
 
 
466 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  43.41 
 
 
487 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1449  diguanylate cyclase  39.89 
 
 
466 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  34.74 
 
 
659 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  44 
 
 
487 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.21 
 
 
599 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0645  GGDEF domain-containing protein  39.89 
 
 
454 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  44 
 
 
487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0508  GGDEF domain-containing protein  39.89 
 
 
454 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  43.01 
 
 
645 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1222  GGDEF domain-containing protein  39.89 
 
 
466 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.36 
 
 
1078 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  41.82 
 
 
490 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  44 
 
 
528 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  42.27 
 
 
696 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  40 
 
 
611 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  31.75 
 
 
487 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  40.3 
 
 
382 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1842  diguanylate cyclase  42.41 
 
 
308 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  38.8 
 
 
370 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  41.28 
 
 
508 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.41 
 
 
353 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>