More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0366 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  100 
 
 		 361 aa  722    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  99.72 
 
 		 370 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  100 
 
 		 361 aa  722    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  49.3 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  49.3 
 
 		 360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  49.3 
 
 		 360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  48.3 
 
 		 388 aa  308  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  44.66 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  46.07 
 
 		 373 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  46.07 
 
 		 373 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  46.07 
 
 		 373 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  43.94 
 
 		 361 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  43.94 
 
 		 361 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  41.16 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  43.93 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  43.66 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  40.73 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  47.7 
 
 		 286 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  34.47 
 
 		 375 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 371 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  34.47 
 
 		 375 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  31.53 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  32.3 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  32.29 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  32.04 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  31.23 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  31.37 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  32.37 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  34.16 
 
 		 532 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 532 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1227  diguanylate cyclase  41.82 
 
 		 554 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.594022  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0747  diguanylate cyclase  33.02 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 680 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3406  diguanylate cyclase  35.63 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.48 
 
 		 836 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1665  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 530 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2364  diguanylate cyclase  40.57 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000850784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3475  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.8 
 
 		 571 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.12 
 
 		 689 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0060  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.88 
 
 		 815 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 557 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  28.8 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.18 
 
 		 1038 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 587 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  43.37 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1695  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.69 
 
 		 594 aa  96.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.2 
 
 		 1072 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.59 
 
 		 632 aa  96.7  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2035  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.59 
 
 		 468 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.0433379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.41 
 
 		 842 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0664928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2174  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 467 aa  96.3  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.14 
 
 		 367 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0119  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 322 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0821  diguanylate cyclase  41.04 
 
 		 545 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.117873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 608 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3191  diguanylate cyclase  32.24 
 
 		 646 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000281048  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0773  diguanylate cyclase  32.24 
 
 		 646 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000965334  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.4 
 
 		 739 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  32.49 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3337  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.59 
 
 		 1020 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3859  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  31.1 
 
 		 631 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  38.15 
 
 		 719 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0782  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000969424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  34.36 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.75 
 
 		 450 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000908772  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0983  GGDEF family protein  36.52 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 923 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2043  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.92 
 
 		 442 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0787924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 540 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1403  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.02 
 
 		 567 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0679086  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  29.93 
 
 		 498 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0221  GGDEF domain-containing protein  36.69 
 
 		 710 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2469  diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.3 
 
 		 703 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  40.8 
 
 		 559 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  27.37 
 
 		 569 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.79 
 
 		 568 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.04 
 
 		 659 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  40.88 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 611 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0403  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.9 
 
 		 863 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5028  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.64 
 
 		 637 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00518109  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0622  GGDEF family protein  36.81 
 
 		 489 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3507  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.6 
 
 		 1012 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1338  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 469 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0898942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0443  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05845  hypothetical protein  37.72 
 
 		 638 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2631  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.69 
 
 		 467 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00523199  hitchhiker  0.0000140332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2102  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.15 
 
 		 689 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.96 
 
 		 629 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2451  diguanylate cyclase  35.47 
 
 		 287 aa  93.2  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.357432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>