More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4819 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  100 
 
 		 360 aa  715    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  63.54 
 
 		 364 aa  421  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  50.72 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  50.72 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  44.38 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  44.1 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  44.1 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  51.96 
 
 		 286 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  38.9 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  39.65 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  39.65 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  39.65 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  40.73 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  41.09 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  40.73 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  40 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  38.68 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  37.96 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  34.44 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  35.88 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  35.88 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  35.88 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  32.7 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 371 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  32.68 
 
 		 367 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  29.97 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5479  sensory box/GGDEF family protein  40.12 
 
 		 892 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  31.84 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5527  sensory box/GGDEF family protein  40.12 
 
 		 604 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5048  sensory box/GGDEF family protein  40.12 
 
 		 892 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5197  sensory box/GGDEF family protein  40.12 
 
 		 892 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5032  hypothetical protein  40.12 
 
 		 892 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5441  sensory box/GGDEF family protein  40.12 
 
 		 735 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5593  sensory box/GGDEF family protein  40.12 
 
 		 892 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0610  two component response regulator  40.66 
 
 		 649 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5481  sensory box/GGDEF family protein  37.72 
 
 		 735 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242915  hitchhiker  1.94028e-17 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  36.56 
 
 		 735 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.72 
 
 		 892 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1181  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.29 
 
 		 686 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5014  response regulator/sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  39.52 
 
 		 719 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5471  sensory box/GGDEF family protein  37.13 
 
 		 814 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00599956  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3603  GGDEF domain-containing protein  34.32 
 
 		 641 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 559 aa  99.8  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1999  diguanylate cyclase  42.04 
 
 		 612 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.22 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1175  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2927  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.52 
 
 		 547 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88405  normal  0.302817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  40.1 
 
 		 866 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  38.92 
 
 		 719 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 532 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  38.75 
 
 		 645 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  35.52 
 
 		 471 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5099  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 653 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.873917  normal  0.160564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0283  diguanylate cyclase  36.51 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714605  normal  0.0176427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6413  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.64 
 
 		 508 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.905746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1619  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.51 
 
 		 632 aa  97.4  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.702165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6542  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 438 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2593  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 569 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4106  GGDEF domain/EAL domain protein  39.29 
 
 		 756 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  34.52 
 
 		 477 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  39.3 
 
 		 688 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1227  diguanylate cyclase  40.56 
 
 		 554 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.594022  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0356  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.89 
 
 		 667 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.589026  normal  0.448313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3225  diguanylate cyclase  35.54 
 
 		 599 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2262  diguanylate cyclase  33.89 
 
 		 430 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5414  ggdef family protein  35.62 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1496  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.69 
 
 		 741 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001391  GGDEF domain protein  36.56 
 
 		 327 aa  96.3  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00410317  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2597  GGDEF  36.48 
 
 		 534 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0556  diguanylate cyclase  35.83 
 
 		 314 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 384 aa  95.9  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 384 aa  95.9  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  35.2 
 
 		 578 aa  95.9  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 611 aa  95.9  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05442  hypothetical protein  38.55 
 
 		 539 aa  95.9  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  39.39 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  36.7 
 
 		 623 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.11 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1681  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.83 
 
 		 496 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.650455  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39460  guanylyl cyclase  40.12 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.23 
 
 		 769 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  36.75 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0525  diguanylate cyclase  33.96 
 
 		 585 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  30.42 
 
 		 571 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 495 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.13 
 
 		 557 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2594  diguanylate cyclase  39.77 
 
 		 582 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  45.4 
 
 		 530 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  38.15 
 
 		 681 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  36.25 
 
 		 820 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>