More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B5414 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5543  GGDEF domain-containing protein  88.35 
 
 
352 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5414  ggdef family protein  100 
 
 
352 aa  713    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5538  ggdef family protein  89.49 
 
 
352 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5094  hypothetical protein  77.56 
 
 
351 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5111  hypothetical protein  77.56 
 
 
351 aa  559  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5509  GGDEF domain protein  77.27 
 
 
351 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5267  GGDEF domain-containing protein  76.99 
 
 
351 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5664  GGDEF domain-containing protein  76.99 
 
 
351 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5594  GGDEF domain protein  77.56 
 
 
348 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5208  diguanylate cyclase  74.15 
 
 
351 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  36.99 
 
 
363 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  35.39 
 
 
368 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  42.44 
 
 
532 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  40.8 
 
 
355 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1425  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.47 
 
 
483 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.63 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  36.72 
 
 
758 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  38.82 
 
 
457 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  35.75 
 
 
764 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.48 
 
 
1079 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  36.5 
 
 
764 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  36.5 
 
 
764 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2680  diguanylate cyclase  39.02 
 
 
252 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  33.78 
 
 
494 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  34.88 
 
 
395 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0413  GGDEF domain-containing protein  39.9 
 
 
358 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0092  diguanylate cyclase  42.61 
 
 
577 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2703  diguanylate cyclase  37.23 
 
 
339 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  35.21 
 
 
395 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0798  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.18 
 
 
622 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.131749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  40.24 
 
 
628 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  33.68 
 
 
382 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2699  diguanylate cyclase  39.18 
 
 
251 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  38.17 
 
 
409 aa  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0770  diguanylate cyclase  42.5 
 
 
356 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000555933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0787  diguanylate cyclase  42.5 
 
 
356 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0010071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  33.78 
 
 
494 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  38.15 
 
 
523 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  41.07 
 
 
418 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  40.83 
 
 
681 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.96 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  32.08 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  39.29 
 
 
351 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.96 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  40.22 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.39 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.96 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2123  diguanylate cyclase  38.46 
 
 
635 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  38.17 
 
 
640 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2194  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.46 
 
 
636 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  39.18 
 
 
569 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  33.57 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0266  GGDEF  38.92 
 
 
690 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  41.32 
 
 
303 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  33.5 
 
 
405 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0610  two component response regulator  38.37 
 
 
649 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  37.29 
 
 
454 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  41.51 
 
 
355 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.1 
 
 
550 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  38.65 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0303  GGDEF family protein  36.07 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  43.08 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1521  diguanylate cyclase  36.41 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281404  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  38.64 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  34.18 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  41.46 
 
 
571 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.67 
 
 
563 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  35.71 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  37.17 
 
 
732 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1821  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
466 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  38.1 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0652  diguanylate cyclase  38.65 
 
 
280 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  39.88 
 
 
490 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  36.05 
 
 
631 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1926  diguanylate cyclase  39.64 
 
 
466 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647076  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  37.43 
 
 
487 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1802  diguanylate cyclase  34.78 
 
 
263 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.46 
 
 
352 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1903  diguanylate cyclase  39.64 
 
 
466 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  37.93 
 
 
411 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6176  diguanylate cyclase  39.64 
 
 
466 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  38.42 
 
 
512 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.57 
 
 
797 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1891  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
466 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.311116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1485  diguanylate cyclase  39.88 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.83 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2597  diguanylate cyclase  34.15 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  36.87 
 
 
498 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3851  diguanylate cyclase  36.84 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  40.36 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2462  GGDEF domain-containing protein  38.51 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118701  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.44 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3227  diguanylate cyclase  35.75 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.709302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  40.25 
 
 
485 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  39.62 
 
 
485 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1821  diguanylate cyclase  39.23 
 
 
298 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.017871  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  37.93 
 
 
411 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.71 
 
 
457 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14870  diguanylate cyclase  37.29 
 
 
462 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.024895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>