More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1914 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  100 
 
 		 364 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  63.54 
 
 		 360 aa  434  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  50.56 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  50.56 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  52.96 
 
 		 286 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  42.78 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  42.49 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  42.49 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  43.66 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  43.66 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  43.66 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  38 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  37.61 
 
 		 388 aa  205  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  40.45 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  36.87 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  34.54 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 361 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  33.99 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  30.25 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  35.79 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6542  diguanylate cyclase  45.24 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  30.97 
 
 		 374 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  41.55 
 
 		 866 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  36.89 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2057  diguanylate cyclase  29.39 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0373556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  39.88 
 
 		 580 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  34.54 
 
 		 578 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5143  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.86 
 
 		 643 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248831  normal  0.87155 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0659  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 417 aa  99.4  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0149639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2035  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.53 
 
 		 468 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.0433379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0076  diguanylate cyclase  38.43 
 
 		 444 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2597  GGDEF  40.59 
 
 		 534 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0884  diguanylate cyclase  35.86 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.576242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 385 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 623 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 385 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1174  GGDEF domain-containing protein  37.2 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0192  diguanylate cyclase  38.66 
 
 		 462 aa  95.9  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  36.53 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0283  diguanylate cyclase  36.55 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714605  normal  0.0176427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.02 
 
 		 876 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  34.74 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  28.92 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4625  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.69 
 
 		 915 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1761  diguanylate cyclase  31.68 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 446 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 569 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22780  GGDEF protein  40.24 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0043996  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  34.27 
 
 		 540 aa  93.2  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  39.39 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1619  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.51 
 
 		 632 aa  93.2  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.702165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3603  GGDEF domain-containing protein  38.07 
 
 		 641 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.18 
 
 		 568 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0333  GGDEF domain-containing protein  34.91 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1887  diguanylate cyclase  35.03 
 
 		 517 aa  92.8  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0233  signal protein domain/GGDEF domain-containing protein  35.75 
 
 		 791 aa  92.4  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  33.5 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5469  GGDEF  36.18 
 
 		 419 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0356  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.11 
 
 		 667 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.589026  normal  0.448313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.39 
 
 		 407 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  36.84 
 
 		 565 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1814  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  39.46 
 
 		 689 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2075  GGDEF protein  37.5 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01318  predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein  36.67 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.536328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2303  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.67 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2458  diguanylate cyclase  35.59 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1458  sensory box-containing diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1542  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.52 
 
 		 1006 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1175  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 269 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5481  sensory box/GGDEF family protein  35.15 
 
 		 735 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242915  hitchhiker  1.94028e-17 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.29 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  36.2 
 
 		 650 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  39.2 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2594  diguanylate cyclase  40.11 
 
 		 582 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1781  sensory box-containing diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1555  sensory box-containing diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01328  hypothetical protein  36.67 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.465042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1989  sensory box-containing diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.88 
 
 		 557 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1356  diguanylate cyclase  37.71 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0610  two component response regulator  40.36 
 
 		 649 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3252  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.24 
 
 		 620 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0697  diguanylate cyclase  39.64 
 
 		 264 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.184616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  35.87 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  34.68 
 
 		 611 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>