More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1659 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1659  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 
342 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1397  GAF domain/diguanylate cyclase domain-containing protein  67.06 
 
 
341 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.210623  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1839  diguanylate cyclase with GAF sensor  67.06 
 
 
341 aa  478  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730013  normal  0.326474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01763  predicted diguanylate cyclase  66.76 
 
 
341 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.623306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1849  diguanylate cyclase with GAF sensor  67.06 
 
 
341 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1880  GAF domain/diguanylate cyclase domain-containing protein  66.76 
 
 
384 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2018  GAF domain/diguanylate cyclase domain-containing protein  66.76 
 
 
384 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000229251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2518  GAF domain/diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  66.47 
 
 
384 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01751  hypothetical protein  66.76 
 
 
341 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1350  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.58 
 
 
348 aa  346  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0071  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.37 
 
 
336 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1599  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.67 
 
 
343 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3840  putative diguanylate cyclase  44.31 
 
 
338 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.93592  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0175  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.9 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.14726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3131  diguanylate cyclase  33.59 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388366 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  31.83 
 
 
1057 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.95 
 
 
1212 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1611  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.34 
 
 
946 aa  109  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.319418  normal  0.0964053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3959  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.76 
 
 
855 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4627  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.95 
 
 
585 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1931  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.36 
 
 
1289 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0959119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4673  hypothetical protein  34.8 
 
 
651 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3265  GGDEF domain-containing protein  38.73 
 
 
862 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00136665  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.16 
 
 
1144 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3580  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.91 
 
 
873 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2200  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.2 
 
 
637 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3598  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.77 
 
 
877 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.99 
 
 
639 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  32.23 
 
 
794 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3664  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.19 
 
 
759 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0469  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.77 
 
 
874 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1411  diguanylate cyclase  37.64 
 
 
656 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3599  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.77 
 
 
944 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477673  normal  0.896375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.85 
 
 
882 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4105  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.85 
 
 
882 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3989  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.85 
 
 
882 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  34.13 
 
 
372 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4119  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.04 
 
 
543 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.158695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3588  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.55 
 
 
827 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0360121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.98 
 
 
1247 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.33 
 
 
875 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00996719  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1898  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.36 
 
 
913 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.456736  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2820  hypothetical protein  28.14 
 
 
332 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2678  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.23 
 
 
515 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1362  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.36 
 
 
862 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.525156  hitchhiker  0.0000167572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0547  sensory box protein  33.16 
 
 
1214 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4324  GGDEF domain-containing protein  37.29 
 
 
876 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2061  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  39.33 
 
 
900 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.0846587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0071  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.38 
 
 
863 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213956  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
215 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00077  Intracellular signaling protein (GAF,GGDEF,EAL domains)  36.67 
 
 
866 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.5 
 
 
781 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0407  GGDEF domain-containing protein  37.63 
 
 
873 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0669941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1219  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.29 
 
 
792 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1884  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.33 
 
 
900 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.996671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3649  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.85 
 
 
876 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.02582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3231  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.88 
 
 
313 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.458607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0375  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.85 
 
 
876 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413916  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0306  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.36 
 
 
882 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.212751  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0377  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.85 
 
 
876 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0140415  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2490  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.82 
 
 
962 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.297128  normal  0.0871585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4068  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.05 
 
 
324 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1139  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.7 
 
 
883 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00209756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1867  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.53 
 
 
926 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.233383  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0015  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.11 
 
 
847 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5899  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.11 
 
 
918 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224493  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  35.83 
 
 
429 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.84 
 
 
840 aa  99.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.34 
 
 
703 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.64 
 
 
765 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  34.39 
 
 
1247 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0235  GAF/GGDEF domain-containing protein  31.75 
 
 
391 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3769  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.5 
 
 
732 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.47 
 
 
1107 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.95 
 
 
397 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53310  hypothetical protein  32.79 
 
 
681 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  41.77 
 
 
873 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0483164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1202  GGDEF domain-containing protein  29.8 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.39 
 
 
1247 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.53 
 
 
867 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.81451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.62 
 
 
1054 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.68 
 
 
878 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.95 
 
 
397 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4974  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.68 
 
 
877 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1160  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.68 
 
 
878 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1520  GGDEF domain-containing protein  29.05 
 
 
323 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  34.9 
 
 
882 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0215  GAF/GGDEF domain-containing protein  31.75 
 
 
391 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.84 
 
 
874 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0693  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.75 
 
 
664 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  36.23 
 
 
601 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4436  diguanylate cyclase  40.44 
 
 
422 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  hitchhiker  0.000180692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.89 
 
 
695 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.43 
 
 
891 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.75 
 
 
664 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 
737 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3230  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.17 
 
 
872 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3694  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.75 
 
 
664 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5027  diguanylate cyclase  37.02 
 
 
422 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750126  normal  0.244127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2499  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.45 
 
 
615 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0730388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>