85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0449 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  100 
 
 
716 aa  1446    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  33.33 
 
 
647 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  34.35 
 
 
641 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  32.98 
 
 
652 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  32.03 
 
 
660 aa  353  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  32.58 
 
 
644 aa  345  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  28.28 
 
 
807 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  29.2 
 
 
715 aa  287  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  31.69 
 
 
802 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  29.42 
 
 
684 aa  280  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  29.66 
 
 
678 aa  280  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  33.33 
 
 
536 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  28.64 
 
 
697 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  28.85 
 
 
680 aa  271  4e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  27.16 
 
 
679 aa  263  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  27.39 
 
 
625 aa  244  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  29.23 
 
 
601 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  27.34 
 
 
610 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  25.89 
 
 
625 aa  207  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  37.41 
 
 
349 aa  206  9e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  37.17 
 
 
306 aa  196  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  38.59 
 
 
328 aa  194  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  38.74 
 
 
349 aa  187  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  35.88 
 
 
329 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  34.6 
 
 
307 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  37.79 
 
 
296 aa  167  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  41.2 
 
 
224 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  33.88 
 
 
290 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  30.77 
 
 
332 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  27.24 
 
 
450 aa  108  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  20.68 
 
 
604 aa  106  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  27.4 
 
 
300 aa  90.5  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  30.19 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  23.53 
 
 
582 aa  68.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  22.55 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  23.27 
 
 
590 aa  65.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  22.99 
 
 
581 aa  63.9  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  24.44 
 
 
578 aa  63.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  21.39 
 
 
554 aa  60.8  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  26.06 
 
 
658 aa  59.7  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  22.83 
 
 
300 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  21.95 
 
 
325 aa  55.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25 
 
 
317 aa  55.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  22.86 
 
 
300 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  22.91 
 
 
307 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  21.93 
 
 
325 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  16.83 
 
 
574 aa  52.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  22.22 
 
 
328 aa  52  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  20.25 
 
 
517 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  17.89 
 
 
577 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  21.55 
 
 
325 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  21.55 
 
 
325 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  21.51 
 
 
325 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  18.72 
 
 
558 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  22.9 
 
 
325 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  26.42 
 
 
325 aa  48.5  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  27.32 
 
 
256 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  22.9 
 
 
325 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  20.69 
 
 
325 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  22.01 
 
 
261 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1337  type II secretion system protein  25.77 
 
 
289 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  22.91 
 
 
307 aa  47.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  21.55 
 
 
287 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  21.23 
 
 
558 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  22.7 
 
 
558 aa  47  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  20.62 
 
 
293 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  22.38 
 
 
616 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1094  conserved hypothetical protein  21 
 
 
503 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00376614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  23.81 
 
 
295 aa  46.2  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  23.85 
 
 
330 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  20 
 
 
325 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  21.93 
 
 
615 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1198  type II secretion system protein  20.32 
 
 
620 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.665055  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  21.23 
 
 
558 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  24.28 
 
 
288 aa  45.8  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  22.05 
 
 
311 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  23.48 
 
 
322 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  23.33 
 
 
326 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  23.17 
 
 
320 aa  45.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  20.55 
 
 
558 aa  44.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  17.11 
 
 
287 aa  44.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0425  type II secretion system protein  26.03 
 
 
271 aa  44.3  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0854  type II secretion system protein  21.3 
 
 
261 aa  44.3  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243873  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  20 
 
 
279 aa  43.9  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  22.99 
 
 
275 aa  43.9  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>