35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1731 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  93.73 
 
 
558 aa  1041    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  94.8 
 
 
558 aa  1042    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  60.04 
 
 
558 aa  716    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  85.48 
 
 
558 aa  984    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  100 
 
 
558 aa  1130    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  35.69 
 
 
551 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  32.42 
 
 
574 aa  317  5e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  32.78 
 
 
554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  30.69 
 
 
581 aa  302  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  30.82 
 
 
582 aa  296  7e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  31.62 
 
 
578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  30.28 
 
 
577 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  20.73 
 
 
517 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  22.63 
 
 
539 aa  90.1  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  21.28 
 
 
545 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  20 
 
 
532 aa  78.2  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  22.42 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  21.02 
 
 
546 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  21.41 
 
 
534 aa  64.3  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  24.65 
 
 
678 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  24.82 
 
 
679 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  23.15 
 
 
697 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  23.94 
 
 
684 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  17.69 
 
 
475 aa  54.7  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  21.13 
 
 
680 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  24.41 
 
 
332 aa  50.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  19.89 
 
 
610 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  24.59 
 
 
652 aa  47.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  24.64 
 
 
807 aa  47.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  23.03 
 
 
300 aa  47  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  21.69 
 
 
716 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  25.64 
 
 
802 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  24.16 
 
 
715 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  23.38 
 
 
307 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  27.45 
 
 
290 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>