45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2404 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 678 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  30 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 716 aa  90.5  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  28.25 
 
 		 697 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  26.87 
 
 		 684 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  26.47 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 680 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 647 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  28.97 
 
 		 601 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 679 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 802 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  25.6 
 
 		 625 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 652 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 641 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 807 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  25.26 
 
 		 660 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  28.73 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  23.9 
 
 		 625 aa  63.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  20 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  23.04 
 
 		 578 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  25.5 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  22.51 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  22.55 
 
 		 715 aa  55.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  21.71 
 
 		 581 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  19.75 
 
 		 574 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  22.09 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  21.62 
 
 		 658 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  23.9 
 
 		 551 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 615 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  22.15 
 
 		 558 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  21.52 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  22.28 
 
 		 616 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  21.66 
 
 		 558 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  21.52 
 
 		 558 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1152  type II secretion system protein  28 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  28.26 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  20.89 
 
 		 558 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  21.74 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>