47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2002 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  100 
 
 		 307 aa  619  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  72.73 
 
 		 224 aa  338  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  58.98 
 
 		 296 aa  338  9e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  39.68 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  35.81 
 
 		 716 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  34.5 
 
 		 647 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  34.01 
 
 		 641 aa  155  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  33.22 
 
 		 644 aa  143  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  31.15 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  34.84 
 
 		 652 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  28.97 
 
 		 660 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 680 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  31.02 
 
 		 625 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 802 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 715 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  35.52 
 
 		 601 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 807 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  27.99 
 
 		 684 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 610 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  34.07 
 
 		 536 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 678 aa  96.7  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  28.02 
 
 		 697 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 679 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 625 aa  89.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1905  hypothetical protein  59.38 
 
 		 65 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.454467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 604 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  25 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  24.58 
 
 		 574 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  27.57 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  29.52 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  24.08 
 
 		 581 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  22.56 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  21.81 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  23.67 
 
 		 616 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 590 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  23.57 
 
 		 551 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 615 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  23.97 
 
 		 558 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0218  type II secretion system protein  22.68 
 
 		 664 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.444432  normal  0.0181412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  23.97 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  25.58 
 
 		 558 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  23.29 
 
 		 558 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  23.29 
 
 		 558 aa  42.4  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>