41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2569 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  56.6 
 
 		 582 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  55.15 
 
 		 581 aa  640    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  100 
 
 		 578 aa  1170    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  50.95 
 
 		 574 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  46.83 
 
 		 577 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  30.25 
 
 		 551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  32.09 
 
 		 558 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  32.16 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  30.04 
 
 		 558 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  32.49 
 
 		 558 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  30.54 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  30.68 
 
 		 558 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  25.12 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  20.88 
 
 		 517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  26.16 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  25.64 
 
 		 534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  22.69 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  25.57 
 
 		 545 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  25 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  24.17 
 
 		 680 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  20 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  21.78 
 
 		 802 aa  63.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 716 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  23 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  23.04 
 
 		 300 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  21.98 
 
 		 697 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  21.12 
 
 		 684 aa  58.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  23.4 
 
 		 679 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  25 
 
 		 807 aa  54.3  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 715 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  23.28 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  21.23 
 
 		 601 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  25 
 
 		 660 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  17.44 
 
 		 475 aa  51.2  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 610 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  22.34 
 
 		 652 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 604 aa  47.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  22.73 
 
 		 625 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  20 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  21.03 
 
 		 647 aa  44.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>