51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3138 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  60.06 
 
 
680 aa  812    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  61.46 
 
 
678 aa  817    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
684 aa  1386    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  62.84 
 
 
679 aa  808    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  79.63 
 
 
697 aa  1110    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  29.42 
 
 
716 aa  273  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  29.22 
 
 
644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  29.2 
 
 
652 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  26.78 
 
 
641 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  25.19 
 
 
647 aa  207  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  24.53 
 
 
660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  27.12 
 
 
715 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  26.79 
 
 
802 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  24.7 
 
 
807 aa  177  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  23.16 
 
 
625 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  27.82 
 
 
536 aa  157  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  26.16 
 
 
601 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  25.7 
 
 
625 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  24.47 
 
 
610 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  34.55 
 
 
306 aa  124  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  29.04 
 
 
349 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  27.22 
 
 
349 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  26.49 
 
 
328 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  27.05 
 
 
329 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  27.96 
 
 
307 aa  97.4  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  28.86 
 
 
332 aa  96.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  26.44 
 
 
224 aa  89.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2054  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
633 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.647087  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  26.87 
 
 
300 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  24.29 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  27.05 
 
 
296 aa  76.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  24.9 
 
 
581 aa  70.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  22.82 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  25.95 
 
 
582 aa  67  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  25 
 
 
554 aa  63.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.87 
 
 
295 aa  62.4  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  28.86 
 
 
558 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  21.12 
 
 
578 aa  58.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  22.22 
 
 
574 aa  58.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  24.65 
 
 
558 aa  57.4  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  24.41 
 
 
558 aa  57.4  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  23.94 
 
 
558 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  23.94 
 
 
558 aa  53.9  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  24.14 
 
 
284 aa  52  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  23.45 
 
 
551 aa  52  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  23.61 
 
 
300 aa  50.8  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  25.81 
 
 
658 aa  50.8  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1198  type II secretion system protein  23.28 
 
 
620 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.665055  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  21.98 
 
 
604 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  24.49 
 
 
284 aa  45.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  18.95 
 
 
590 aa  44.7  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>