39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0253 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  100 
 
 
306 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  39.68 
 
 
307 aa  225  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  47.91 
 
 
224 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  40.07 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  37.17 
 
 
716 aa  206  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  34.55 
 
 
647 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  34.01 
 
 
652 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  32.65 
 
 
644 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  33 
 
 
332 aa  142  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  31.23 
 
 
641 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  30.66 
 
 
660 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  33.82 
 
 
610 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  29.9 
 
 
678 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  33.55 
 
 
684 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  31.4 
 
 
680 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  32.68 
 
 
601 aa  115  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  31.06 
 
 
679 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  31.65 
 
 
697 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  29.18 
 
 
625 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  26.37 
 
 
807 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  34.21 
 
 
625 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  32.21 
 
 
802 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  30.9 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  30.17 
 
 
715 aa  92.8  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  27.78 
 
 
536 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  27.66 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  26.45 
 
 
590 aa  65.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  25.29 
 
 
658 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  23 
 
 
604 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  20.99 
 
 
582 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  23.16 
 
 
577 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  28.21 
 
 
551 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  22.16 
 
 
581 aa  52.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  20.28 
 
 
574 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  20 
 
 
578 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  28.21 
 
 
558 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  23.31 
 
 
554 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  22.73 
 
 
558 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  23.38 
 
 
558 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>