92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2722 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  100 
 
 
807 aa  1599    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  53.68 
 
 
802 aa  797    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  40.92 
 
 
715 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  43.4 
 
 
536 aa  360  7e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  29.66 
 
 
647 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  30.9 
 
 
644 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  31.31 
 
 
641 aa  291  4e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  28.28 
 
 
716 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  31.64 
 
 
652 aa  280  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  27.73 
 
 
660 aa  227  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  24.08 
 
 
625 aa  190  8e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  26.79 
 
 
680 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  24.7 
 
 
684 aa  177  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  25.9 
 
 
679 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  25 
 
 
697 aa  163  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  24.31 
 
 
678 aa  160  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  24.82 
 
 
601 aa  151  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  28.97 
 
 
349 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  24.27 
 
 
610 aa  147  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  23.78 
 
 
625 aa  128  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  28.4 
 
 
328 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  25.62 
 
 
329 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  25.43 
 
 
349 aa  122  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  26.19 
 
 
290 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  27.21 
 
 
306 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  30.15 
 
 
307 aa  101  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  28.4 
 
 
296 aa  98.6  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  30.37 
 
 
224 aa  97.8  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  29.63 
 
 
332 aa  89.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  22.57 
 
 
450 aa  87.8  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  24.03 
 
 
295 aa  67  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  24.12 
 
 
300 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0052  hypothetical protein  38.79 
 
 
377 aa  65.1  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1951  hypothetical protein  37.8 
 
 
974 aa  65.1  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  40.7 
 
 
1374 aa  64.3  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4788  hypothetical protein  37.36 
 
 
855 aa  64.3  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1511  hypothetical protein  40.45 
 
 
676 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0798411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  41.57 
 
 
1578 aa  59.7  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5172  hypothetical protein  35.56 
 
 
735 aa  58.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  26.24 
 
 
320 aa  57  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  20.36 
 
 
581 aa  57  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.99 
 
 
307 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.09 
 
 
314 aa  55.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.23 
 
 
643 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  28.19 
 
 
311 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1886  hypothetical protein  29.77 
 
 
136 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  29.19 
 
 
311 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  25 
 
 
578 aa  54.3  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1869  hypothetical protein  31.03 
 
 
421 aa  53.9  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  28.37 
 
 
320 aa  53.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  26.92 
 
 
317 aa  52.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2920  hypothetical protein  29.01 
 
 
136 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000191516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  28.99 
 
 
311 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  23.76 
 
 
293 aa  51.6  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.18 
 
 
323 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  17.41 
 
 
604 aa  50.8  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  26.64 
 
 
328 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  28.57 
 
 
288 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  27.73 
 
 
313 aa  50.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2088  hypothetical protein  28.83 
 
 
183 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  27.12 
 
 
554 aa  49.3  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  25.29 
 
 
318 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  24.77 
 
 
256 aa  48.5  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  22.54 
 
 
590 aa  48.5  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  23.75 
 
 
294 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.78 
 
 
660 aa  48.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  24.64 
 
 
558 aa  47.8  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  25.36 
 
 
558 aa  47.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  29.06 
 
 
301 aa  47  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  26.47 
 
 
300 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  24.64 
 
 
558 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  29.53 
 
 
312 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  30 
 
 
313 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.53 
 
 
287 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  20.59 
 
 
615 aa  46.6  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  23.86 
 
 
307 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  24.64 
 
 
558 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  23.57 
 
 
284 aa  47  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  27.56 
 
 
574 aa  46.2  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  25.16 
 
 
313 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  22.22 
 
 
551 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.82 
 
 
313 aa  46.2  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  26.62 
 
 
323 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  27.97 
 
 
313 aa  46.2  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  28.33 
 
 
582 aa  45.8  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  28.57 
 
 
298 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  25.93 
 
 
293 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25 
 
 
287 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  25.88 
 
 
300 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  27.1 
 
 
324 aa  45.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  26.67 
 
 
316 aa  44.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  26.11 
 
 
326 aa  44.3  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>