45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0961 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  68.95 
 
 
582 aa  802    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  100 
 
 
581 aa  1176    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  55.15 
 
 
578 aa  654    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  52 
 
 
574 aa  610  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  48.97 
 
 
577 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  30.92 
 
 
551 aa  329  8e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  32.76 
 
 
554 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  30.51 
 
 
558 aa  310  5e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  30.86 
 
 
558 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  30.66 
 
 
558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  30.08 
 
 
558 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  29.82 
 
 
558 aa  277  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  21.39 
 
 
517 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  27.13 
 
 
532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  25.27 
 
 
534 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  22.73 
 
 
546 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  21.13 
 
 
539 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  24.05 
 
 
545 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  27.23 
 
 
697 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  25.67 
 
 
684 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  25.43 
 
 
680 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  23.47 
 
 
716 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  22.46 
 
 
296 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  23.14 
 
 
678 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  23.79 
 
 
307 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  24.28 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  18.14 
 
 
475 aa  60.5  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  20.81 
 
 
473 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  25.12 
 
 
224 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  22.9 
 
 
644 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  20.36 
 
 
807 aa  57.4  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  24.26 
 
 
679 aa  57  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  26.38 
 
 
610 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  22.93 
 
 
306 aa  54.7  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  23.67 
 
 
625 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  22.91 
 
 
300 aa  54.3  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  27.14 
 
 
715 aa  53.9  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  22.75 
 
 
652 aa  51.2  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  21.92 
 
 
625 aa  50.8  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  22.12 
 
 
647 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  21.71 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  27.85 
 
 
802 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  19.68 
 
 
290 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  19.58 
 
 
615 aa  45.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  26.81 
 
 
536 aa  43.5  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>