36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0949 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  95.7 
 
 
558 aa  1058    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  100 
 
 
558 aa  1129    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  60.93 
 
 
558 aa  732    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  84.59 
 
 
558 aa  981    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  94.8 
 
 
558 aa  1048    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  35.21 
 
 
551 aa  365  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  32.14 
 
 
574 aa  309  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  29.98 
 
 
581 aa  300  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  32.91 
 
 
554 aa  296  5e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  30.81 
 
 
582 aa  286  7e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  32.43 
 
 
578 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  30.69 
 
 
577 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  22.58 
 
 
517 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  22.89 
 
 
539 aa  89.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  21.45 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  20.65 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  21.93 
 
 
545 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  23.14 
 
 
473 aa  72  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  25.35 
 
 
678 aa  64.7  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  25.53 
 
 
679 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  20.73 
 
 
534 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  23.61 
 
 
697 aa  58.9  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  24.65 
 
 
684 aa  57.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  21.83 
 
 
680 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  17.97 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  24.59 
 
 
652 aa  51.2  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  24.38 
 
 
307 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  19.14 
 
 
716 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  24.41 
 
 
332 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  22.97 
 
 
224 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  19.78 
 
 
610 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  24.64 
 
 
807 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  25.64 
 
 
802 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  24.41 
 
 
715 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  26.27 
 
 
290 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  20.55 
 
 
296 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>