22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0105 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  100 
 
 
534 aa  1075    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  52.45 
 
 
532 aa  552  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  49.42 
 
 
546 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  46.71 
 
 
545 aa  477  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  37.11 
 
 
517 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  33.08 
 
 
539 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  25.64 
 
 
578 aa  127  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  25 
 
 
582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  25.27 
 
 
581 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  23.56 
 
 
551 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  22.7 
 
 
574 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  23.85 
 
 
577 aa  97.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  22.93 
 
 
554 aa  95.9  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  22.32 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  21.41 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  21.41 
 
 
558 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  21.01 
 
 
558 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  21.12 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  21.43 
 
 
558 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  21.93 
 
 
473 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  23.65 
 
 
296 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  23.81 
 
 
807 aa  43.5  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>