21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0948 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  100 
 
 		 532 aa  1076    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  54.56 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  52.83 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  51.94 
 
 		 545 aa  565  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  35.73 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  34.48 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  26.65 
 
 		 554 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  24.9 
 
 		 581 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  26.65 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 582 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  24.55 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  23.47 
 
 		 577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  24.13 
 
 		 574 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  21.74 
 
 		 558 aa  90.9  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  20.76 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  20.4 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  20.25 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  22.64 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  20.57 
 
 		 473 aa  53.5  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  20.98 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  28.17 
 
 		 601 aa  47.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>