38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1317 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
554 aa  1125    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  35.69 
 
 
551 aa  350  5e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  31.68 
 
 
574 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  32.13 
 
 
581 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  34.19 
 
 
558 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  34.34 
 
 
558 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  34.48 
 
 
558 aa  299  8e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  33.47 
 
 
558 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  31.12 
 
 
582 aa  292  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  30.54 
 
 
578 aa  280  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  31.09 
 
 
577 aa  280  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  32.01 
 
 
558 aa  279  9e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  26.65 
 
 
532 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  22.68 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  26.3 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  24.24 
 
 
545 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  25.52 
 
 
539 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  23.29 
 
 
534 aa  90.5  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  25 
 
 
684 aa  69.3  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  25.33 
 
 
697 aa  65.1  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  22.91 
 
 
473 aa  64.3  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  19.35 
 
 
475 aa  61.6  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  20.1 
 
 
716 aa  61.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  22.45 
 
 
307 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  24.39 
 
 
680 aa  57  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  22.75 
 
 
224 aa  53.9  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  24.74 
 
 
306 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  25.93 
 
 
807 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  22.4 
 
 
332 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  26.6 
 
 
660 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  24.87 
 
 
647 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  20.6 
 
 
678 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  24.26 
 
 
679 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  27.14 
 
 
601 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  21.69 
 
 
652 aa  47.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  21.69 
 
 
296 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  23.28 
 
 
641 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  22.97 
 
 
715 aa  43.9  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>