21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1964 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  100 
 
 		 517 aa  1046    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  37.89 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  37.11 
 
 		 534 aa  312  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  32.46 
 
 		 546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  34.66 
 
 		 532 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  32.16 
 
 		 545 aa  286  9e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  27.31 
 
 		 551 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  26.05 
 
 		 574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  20.88 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  22.68 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  21.39 
 
 		 581 aa  125  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  22.89 
 
 		 558 aa  120  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  22.58 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  21.84 
 
 		 577 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  20.73 
 
 		 558 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  21.38 
 
 		 558 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  22.19 
 
 		 582 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  21.31 
 
 		 558 aa  107  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  26.16 
 
 		 475 aa  93.6  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  20.35 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  20.28 
 
 		 716 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>