39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1575 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  100 
 
 
551 aa  1121    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  35.57 
 
 
558 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  35.87 
 
 
558 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  35.39 
 
 
558 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  35.03 
 
 
558 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  34.12 
 
 
558 aa  350  5e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  35.69 
 
 
554 aa  347  5e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  30.92 
 
 
581 aa  332  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  32.33 
 
 
582 aa  332  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  31.5 
 
 
574 aa  322  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  30.25 
 
 
578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  32.72 
 
 
577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  27.31 
 
 
517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  23.61 
 
 
539 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  23.92 
 
 
546 aa  114  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  24.42 
 
 
532 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  24.06 
 
 
545 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  22.5 
 
 
534 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  19.9 
 
 
473 aa  73.6  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  19.85 
 
 
475 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  26.43 
 
 
610 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  31.89 
 
 
625 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  24.06 
 
 
332 aa  57.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  23.45 
 
 
684 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  28.21 
 
 
306 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  20.46 
 
 
802 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  24.35 
 
 
697 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  23.84 
 
 
224 aa  53.5  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  27.61 
 
 
715 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  23.64 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  21.69 
 
 
307 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  23.24 
 
 
678 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  23.45 
 
 
601 aa  48.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  22.51 
 
 
680 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  25.77 
 
 
652 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  23.9 
 
 
300 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  22.22 
 
 
807 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  19.24 
 
 
644 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  19.86 
 
 
536 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>