43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1904 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  72.73 
 
 		 307 aa  338  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  65.61 
 
 		 296 aa  289  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  47.91 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  41.2 
 
 		 716 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  39.07 
 
 		 647 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  40.1 
 
 		 652 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  40.7 
 
 		 644 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  33.97 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  35.98 
 
 		 641 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 610 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  34.48 
 
 		 660 aa  104  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 625 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 807 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 680 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  28.97 
 
 		 697 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 802 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 715 aa  95.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  36.13 
 
 		 601 aa  94.7  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  34.27 
 
 		 625 aa  91.7  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  26.44 
 
 		 684 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  28.84 
 
 		 678 aa  89.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 300 aa  88.2  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  29.12 
 
 		 536 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 679 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 604 aa  80.9  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 582 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  26.77 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  23 
 
 		 578 aa  61.6  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  22.69 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  24.34 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  28.31 
 
 		 658 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  20.83 
 
 		 577 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  24.2 
 
 		 551 aa  51.6  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  21.79 
 
 		 554 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 615 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  22.97 
 
 		 558 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  22.97 
 
 		 558 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 590 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0910  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 352 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  22.3 
 
 		 558 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  24.55 
 
 		 616 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  32.69 
 
 		 330 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>