28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0494 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 658 aa  1286    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 590 aa  114  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1094  conserved hypothetical protein  26.01 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00376614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  24.09 
 
 		 604 aa  92  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1198  type II secretion system protein  23.92 
 
 		 620 aa  82  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.665055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2105  hypothetical protein  26.04 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.282872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  25.6 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 647 aa  64.3  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 307 aa  62  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  22.35 
 
 		 615 aa  60.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 716 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  25.41 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  21.75 
 
 		 610 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  25.49 
 
 		 625 aa  57  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 224 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  21.37 
 
 		 616 aa  55.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  29.27 
 
 		 652 aa  55.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  22.28 
 
 		 284 aa  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  25.81 
 
 		 684 aa  50.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  22.58 
 
 		 296 aa  48.5  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  21.62 
 
 		 300 aa  48.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  25.37 
 
 		 660 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 680 aa  48.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 641 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  25.13 
 
 		 697 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  23.84 
 
 		 625 aa  44.3  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>