63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0732 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  100 
 
 		 660 aa  1332    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  35.25 
 
 		 647 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  32.32 
 
 		 716 aa  364  3e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 644 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 641 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 652 aa  289  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  26.39 
 
 		 715 aa  277  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  28.45 
 
 		 802 aa  248  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 807 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  28.03 
 
 		 625 aa  241  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  30.55 
 
 		 536 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  24.53 
 
 		 684 aa  216  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  26.18 
 
 		 601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 678 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 625 aa  210  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  24.53 
 
 		 697 aa  207  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  23.85 
 
 		 679 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 680 aa  182  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  32.11 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 329 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  29.39 
 
 		 328 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  30 
 
 		 306 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 296 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  33.98 
 
 		 307 aa  124  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  29.49 
 
 		 290 aa  114  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  32.62 
 
 		 224 aa  112  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  27.92 
 
 		 332 aa  102  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  22.63 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  25.94 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  25.5 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  22.55 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  26.15 
 
 		 290 aa  53.9  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  27.12 
 
 		 554 aa  52.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  25 
 
 		 578 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  21.38 
 
 		 314 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  25.7 
 
 		 658 aa  50.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  23.26 
 
 		 577 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  19.92 
 
 		 590 aa  48.9  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  22.82 
 
 		 307 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  22.15 
 
 		 304 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  17.75 
 
 		 604 aa  48.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2613  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 382 aa  47.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.95954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  19.43 
 
 		 287 aa  47.4  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  21.79 
 
 		 315 aa  47.4  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1871  type II secretion system protein  20.51 
 
 		 248 aa  47.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0937784  normal  0.742106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  21.18 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  20.25 
 
 		 272 aa  46.2  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  20.79 
 
 		 275 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 419 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  20.92 
 
 		 311 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  21.88 
 
 		 317 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 582 aa  44.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  24.02 
 
 		 291 aa  45.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  22.63 
 
 		 310 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  21.38 
 
 		 323 aa  44.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  21.29 
 
 		 295 aa  44.3  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0114  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 411 aa  44.3  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.089481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  18.99 
 
 		 287 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  22.83 
 
 		 615 aa  43.9  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>