47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0313 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  100 
 
 
625 aa  1258    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  49.24 
 
 
610 aa  568  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  45.15 
 
 
601 aa  528  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  31.05 
 
 
647 aa  246  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  31.58 
 
 
652 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  29.72 
 
 
641 aa  224  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  31.45 
 
 
644 aa  223  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  26.68 
 
 
660 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  25.89 
 
 
716 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  24.86 
 
 
715 aa  163  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  25.7 
 
 
684 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  24.08 
 
 
625 aa  143  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  25.23 
 
 
536 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  23.64 
 
 
697 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  24.31 
 
 
678 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  24.17 
 
 
802 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  23.78 
 
 
807 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  23.25 
 
 
680 aa  124  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  25.38 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  34.39 
 
 
306 aa  109  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  27.13 
 
 
349 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  23.12 
 
 
328 aa  99.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  29.88 
 
 
329 aa  98.6  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  25.22 
 
 
349 aa  97.1  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  30.47 
 
 
332 aa  95.5  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  34.27 
 
 
224 aa  95.1  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  30.05 
 
 
307 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  32.53 
 
 
296 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  31.25 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  24.26 
 
 
300 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  31.89 
 
 
551 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  23.74 
 
 
450 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  26.61 
 
 
295 aa  62.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  23.68 
 
 
582 aa  62  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  26.01 
 
 
290 aa  60.1  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  21.4 
 
 
604 aa  58.9  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  23.67 
 
 
581 aa  57.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  25.53 
 
 
261 aa  57.4  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  23.73 
 
 
578 aa  50.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  22.92 
 
 
577 aa  47.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  23.84 
 
 
658 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  21.6 
 
 
317 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0556  type II secretion system protein  27.59 
 
 
313 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29749  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  20.41 
 
 
574 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1869  type II secretion system protein  22.73 
 
 
262 aa  45.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  20.89 
 
 
590 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1402  type II secretion system protein  22.73 
 
 
262 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>