47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2401 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  100 
 
 
647 aa  1316    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  35.25 
 
 
660 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  35.54 
 
 
644 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  35.58 
 
 
652 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  33.64 
 
 
641 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  33.33 
 
 
716 aa  361  3e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  29.66 
 
 
807 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  28.87 
 
 
715 aa  292  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  31.39 
 
 
802 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  28.37 
 
 
625 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  29.98 
 
 
601 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  31.17 
 
 
536 aa  253  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  31.05 
 
 
625 aa  238  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  29.1 
 
 
610 aa  236  8e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  25.19 
 
 
684 aa  207  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  26.6 
 
 
678 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  24.55 
 
 
697 aa  203  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  26.91 
 
 
680 aa  196  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  27.26 
 
 
679 aa  194  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  33.87 
 
 
307 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  30.86 
 
 
349 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  31.8 
 
 
328 aa  162  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  36.84 
 
 
306 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  39.07 
 
 
224 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  30.26 
 
 
329 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  29.79 
 
 
349 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  30.26 
 
 
296 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  29.96 
 
 
290 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  28.81 
 
 
332 aa  107  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  24.59 
 
 
450 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  28.12 
 
 
300 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  21.34 
 
 
590 aa  73.9  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  24.64 
 
 
604 aa  67  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  24.63 
 
 
295 aa  64.7  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  25.24 
 
 
658 aa  64.7  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  24.54 
 
 
284 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  30 
 
 
307 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  21.32 
 
 
582 aa  53.9  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  24.87 
 
 
554 aa  50.4  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  20.75 
 
 
615 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  22.12 
 
 
581 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.83 
 
 
317 aa  47.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2613  type II secretion system protein  29.08 
 
 
382 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.95954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0127  type II secretion system protein  22.45 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.887891  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  25.85 
 
 
558 aa  45.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  21.03 
 
 
578 aa  44.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  25.16 
 
 
288 aa  44.3  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>