42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1458 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  100 
 
 		 625 aa  1272    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 644 aa  319  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  31.12 
 
 		 641 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 652 aa  296  7e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 647 aa  290  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  28.01 
 
 		 716 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  28.76 
 
 		 660 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  27.96 
 
 		 536 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 715 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 802 aa  208  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 807 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  26.95 
 
 		 601 aa  179  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  23.43 
 
 		 684 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  23.13 
 
 		 697 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  22.99 
 
 		 679 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  24.14 
 
 		 678 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 610 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  23.69 
 
 		 680 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  30.55 
 
 		 349 aa  151  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  24.08 
 
 		 625 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  32.81 
 
 		 349 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  28.35 
 
 		 328 aa  142  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  30 
 
 		 329 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  31.98 
 
 		 306 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 307 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  31.63 
 
 		 332 aa  99.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 296 aa  92  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  22.01 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  22.18 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  25.98 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  19.11 
 
 		 604 aa  65.1  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  25.49 
 
 		 658 aa  57  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  22.16 
 
 		 574 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 295 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  21.92 
 
 		 581 aa  50.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  21.71 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  26.67 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  21.53 
 
 		 307 aa  44.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  22.16 
 
 		 261 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>