44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0007 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 332 aa  662    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  30.13 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  38.97 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  31.07 
 
 		 716 aa  135  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  33.97 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  28.01 
 
 		 641 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 647 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  30.16 
 
 		 601 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  34.03 
 
 		 652 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  28.38 
 
 		 660 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 644 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  31.63 
 
 		 625 aa  99.8  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 715 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  28.86 
 
 		 684 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  30.98 
 
 		 697 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  30.47 
 
 		 625 aa  89.4  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 807 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 802 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  24.61 
 
 		 610 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  29.37 
 
 		 680 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  27.59 
 
 		 536 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  25 
 
 		 590 aa  79.3  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 679 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  25.6 
 
 		 658 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  22.95 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  18.18 
 
 		 582 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  23.26 
 
 		 551 aa  53.1  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  22.38 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  21.71 
 
 		 581 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  24.68 
 
 		 558 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  22.22 
 
 		 616 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  24.19 
 
 		 558 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  25.14 
 
 		 558 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  20.81 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  24.04 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0854  type II secretion system protein  19.44 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  15.58 
 
 		 574 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  24.59 
 
 		 558 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  18.4 
 
 		 578 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  20.85 
 
 		 615 aa  42.7  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>